Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SSRP1Q08945 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SSRP1Q08945 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SSRP1Q08945 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SSRP1Q08945 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SSRP1Q08945 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SSRP1Q08945 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SSRP1Q08945 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SSRP1Q08945 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SSRP1Q08945 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SSRP1Q08945 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SSRP1Q08945 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SSRP1Q08945 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SSRP1Q08945 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SSRP1Q08945 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SSRP1Q08945 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SSRP1Q08945 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SSRP1Q08945 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SSRP1Q08945 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SSRP1Q08945 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SSRP1Q08945 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SSRP1Q08945 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SSRP1Q08945 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SSRP1Q08945 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SSRP1Q08945 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SSRP1Q08945 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SSRP1Q08945 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SSRP1Q08945 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SSRP1Q08945 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SSRP1Q08945 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SSRP1Q08945 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SSRP1Q08945 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SSRP1Q08945 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SSRP1Q08945 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SSRP1Q08945 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SSRP1Q08945 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SSRP1Q08945 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SSRP1Q08945 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SSRP1Q08945 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SSRP1Q08945 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SSRP1Q08945 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SSRP1Q08945 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SSRP1Q08945 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SSRP1Q08945 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SSRP1Q08945 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SSRP1Q08945 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SSRP1Q08945 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SSRP1Q08945 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SSRP1Q08945 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SSRP1Q08945 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SSRP1Q08945 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SSRP1Q08945 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SSRP1Q08945 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SSRP1Q08945 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SSRP1Q08945 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SSRP1Q08945 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SSRP1Q08945 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SSRP1Q08945 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SSRP1Q08945 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SSRP1Q08945 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SSRP1Q08945 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SSRP1Q08945 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SSRP1Q08945 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SSRP1Q08945 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SSRP1Q08945 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SSRP1Q08945 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SSRP1Q08945 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SSRP1Q08945 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SSRP1Q08945 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SSRP1Q08945 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SSRP1Q08945 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SSRP1Q08945 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SSRP1Q08945 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SSRP1Q08945 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SSRP1Q08945 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SSRP1Q08945 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SSRP1Q08945 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SSRP1Q08945 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SSRP1Q08945 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SSRP1Q08945 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SSRP1Q08945 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SSRP1Q08945 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SSRP1Q08945 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SSRP1Q08945 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SSRP1Q08945 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SSRP1Q08945 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SSRP1Q08945 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SSRP1Q08945 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SSRP1Q08945 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SSRP1Q08945 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SSRP1Q08945 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SSRP1Q08945 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SSRP1Q08945 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SSRP1Q08945 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SSRP1Q08945 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SSRP1Q08945 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SSRP1Q08945 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SSRP1Q08945 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SSRP1Q08945 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SSRP1Q08945 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms