Protein–RNA interactions for Protein: Q08109

HRD1, ERAD-associated E3 ubiquitin-protein ligase HRD1, yeastyeast

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HRD1Q08109 YJL175WYJL175W 513 nt2.6□□□□□ -1.99
HRD1Q08109 TAF14YPL129W 735 nt2.6□□□□□ -1.99
HRD1Q08109 MRPL37YBR268W 318 nt2.6□□□□□ -1.99
HRD1Q08109 NOP4YPL043W 2058 nt2.6□□□□□ -1.99
HRD1Q08109 RTK1YDL025C 1863 nt2.6□□□□□ -1.99
HRD1Q08109 CDC40YDR364C 1368 nt2.6□□□□□ -1.99
HRD1Q08109 WHI4YDL224C 1950 nt2.6□□□□□ -1.99
HRD1Q08109 UBP8YMR223W 1416 nt2.59□□□□□ -1.99
HRD1Q08109 GWT1YJL091C 1473 nt2.59□□□□□ -1.99
HRD1Q08109 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt2.59□□□□□ -1.99
HRD1Q08109 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.59□□□□□ -1.99
HRD1Q08109 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.59□□□□□ -1.99
HRD1Q08109 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.59□□□□□ -1.99
HRD1Q08109 YER138CYER138C 5268 nt2.59□□□□□ -1.99
HRD1Q08109 YER160CYER160C 5268 nt2.59□□□□□ -1.99
HRD1Q08109 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.59□□□□□ -1.99
HRD1Q08109 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.59□□□□□ -1.99
HRD1Q08109 YJR027WYJR027W 5268 nt2.59□□□□□ -1.99
HRD1Q08109 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.59□□□□□ -1.99
HRD1Q08109 YML039WYML039W 5268 nt2.59□□□□□ -1.99
HRD1Q08109 YML045WYML045W 5268 nt2.59□□□□□ -1.99
HRD1Q08109 YMR050CYMR050C 5268 nt2.59□□□□□ -1.99
HRD1Q08109 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.59□□□□□ -1.99
HRD1Q08109 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.59□□□□□ -1.99
HRD1Q08109 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.59□□□□□ -1.99
HRD1Q08109 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.59□□□□□ -1.99
HRD1Q08109 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.59□□□□□ -1.99
HRD1Q08109 YIL086CYIL086C 309 nt2.59□□□□□ -1.99
HRD1Q08109 SSN8YNL025C 972 nt2.59□□□□□ -1.99
HRD1Q08109 OPY1YBR129C 987 nt2.59□□□□□ -1.99
HRD1Q08109 YPS6YIR039C 1614 nt2.59□□□□□ -1.99
HRD1Q08109 MSM1YGR171C 1728 nt2.59□□□□□ -2
HRD1Q08109 QCR10YHR001W-A 234 nt2.58□□□□□ -2
HRD1Q08109 SNL1YIL016W 480 nt2.58□□□□□ -2
HRD1Q08109 YIL175WYIL175W 318 nt2.58□□□□□ -2
HRD1Q08109 YJL222W-BYJL222W-B 138 nt2.58□□□□□ -2
HRD1Q08109 RPC37YKR025W 849 nt2.58□□□□□ -2
HRD1Q08109 CSM3YMR048W 954 nt2.58□□□□□ -2
HRD1Q08109 TUM1YOR251C 915 nt2.58□□□□□ -2
HRD1Q08109 HPA2YPR193C 471 nt2.58□□□□□ -2
HRD1Q08109 FBP26YJL155C 1359 nt2.58□□□□□ -2
HRD1Q08109 MYO5YMR109W 3660 nt2.58□□□□□ -2
HRD1Q08109 BPT1YLL015W 4680 nt2.57□□□□□ -2
HRD1Q08109 OPI6YDL096C 327 nt2.57□□□□□ -2
HRD1Q08109 SWD2YKL018W 990 nt2.57□□□□□ -2
HRD1Q08109 ERD2YBL040C 660 nt2.57□□□□□ -2
HRD1Q08109 RLP7YNL002C 969 nt2.57□□□□□ -2
HRD1Q08109 NCE103YNL036W 666 nt2.57□□□□□ -2
HRD1Q08109 HUT1YPL244C 1020 nt2.57□□□□□ -2
HRD1Q08109 PCL10YGL134W 1302 nt2.57□□□□□ -2
HRD1Q08109 SWC4YGR002C 1431 nt2.57□□□□□ -2
HRD1Q08109 BNR1YIL159W 4128 nt2.57□□□□□ -2
HRD1Q08109 VPS17YOR132W 1656 nt2.57□□□□□ -2
HRD1Q08109 JJJ1YNL227C 1773 nt2.56□□□□□ -2
HRD1Q08109 ERV14YGL054C 417 nt2.56□□□□□ -2
HRD1Q08109 RPS31YLR167W 459 nt2.56□□□□□ -2
HRD1Q08109 SHE3YBR130C 1278 nt2.56□□□□□ -2
HRD1Q08109 COM2YER130C 1332 nt2.56□□□□□ -2
HRD1Q08109 ESL1YIL151C 3357 nt2.56□□□□□ -2
HRD1Q08109 DSN1YIR010W 1731 nt2.56□□□□□ -2
HRD1Q08109 STE6YKL209C 3873 nt2.55□□□□□ -2
HRD1Q08109 YDR209CYDR209C 414 nt2.55□□□□□ -2
HRD1Q08109 RPB7YDR404C 516 nt2.55□□□□□ -2
HRD1Q08109 PNC1YGL037C 651 nt2.55□□□□□ -2
HRD1Q08109 tQ(UUG)BtQ(UUG)B 72 nt2.55□□□□□ -2
HRD1Q08109 COX23YHR116W 456 nt2.55□□□□□ -2
HRD1Q08109 AIM26YKL037W 357 nt2.55□□□□□ -2
HRD1Q08109 SDH3YKL141W 597 nt2.55□□□□□ -2
HRD1Q08109 MTR2YKL186C 555 nt2.55□□□□□ -2
HRD1Q08109 ADY4YLR227C 1482 nt2.55□□□□□ -2
HRD1Q08109 SEC14YMR079W 915 nt2.55□□□□□ -2
HRD1Q08109 ALG8YOR067C 1734 nt2.55□□□□□ -2
HRD1Q08109 RAS1YOR101W 930 nt2.55□□□□□ -2
HRD1Q08109 RNY1YPL123C 1305 nt2.55□□□□□ -2
HRD1Q08109 AFT2YPL202C 1251 nt2.55□□□□□ -2
HRD1Q08109 SAP1YER047C 2694 nt2.55□□□□□ -2
HRD1Q08109 KIN82YCR091W 2163 nt2.54□□□□□ -2
HRD1Q08109 SKT5YBL061C 2091 nt2.54□□□□□ -2
HRD1Q08109 POL3YDL102W 3294 nt2.54□□□□□ -2
HRD1Q08109 YBR138CYBR138C 1575 nt2.54□□□□□ -2
HRD1Q08109 PSY4YBL046W 1326 nt2.54□□□□□ -2
HRD1Q08109 YHR214C-DYHR214C-D 294 nt2.54□□□□□ -2
HRD1Q08109 AGE2YIL044C 897 nt2.54□□□□□ -2
HRD1Q08109 GLG2YJL137C 1143 nt2.54□□□□□ -2
HRD1Q08109 YAR069CYAR069C 294 nt2.54□□□□□ -2
HRD1Q08109 REC102YLR329W 795 nt2.54□□□□□ -2
HRD1Q08109 YLR416CYLR416C 399 nt2.54□□□□□ -2
HRD1Q08109 MRPL24YMR193W 777 nt2.54□□□□□ -2
HRD1Q08109 RPL20BYOR312C 519 nt2.54□□□□□ -2
HRD1Q08109 MET16YPR167C 786 nt2.54□□□□□ -2
HRD1Q08109 SEC7YDR170C 6030 nt2.54□□□□□ -2
HRD1Q08109 CYR1YJL005W 6081 nt2.54□□□□□ -2
HRD1Q08109 ITC1YGL133W 3795 nt2.54□□□□□ -2
HRD1Q08109 SMC2YFR031C 3513 nt2.54□□□□□ -2
HRD1Q08109 MET5YJR137C 4329 nt2.54□□□□□ -2
HRD1Q08109 YFL040WYFL040W 1623 nt2.53□□□□□ -2
HRD1Q08109 CDC55YGL190C 1581 nt2.53□□□□□ -2
HRD1Q08109 MSH2YOL090W 2895 nt2.53□□□□□ -2
HRD1Q08109 CHS3YBR023C 3498 nt2.53□□□□□ -2
HRD1Q08109 FMP32YFL046W 624 nt2.53□□□□□ -2
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