Protein–RNA interactions for Protein: Q06148

NEJ1, Non-homologous end-joining protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NEJ1Q06148 HMT1YBR034C 1047 nt2.84□□□□□ -1.95
NEJ1Q06148 DIM1YPL266W 957 nt2.84□□□□□ -1.95
NEJ1Q06148 CCT7YJL111W 1653 nt2.84□□□□□ -1.95
NEJ1Q06148 TRE2YOR256C 2430 nt2.83□□□□□ -1.96
NEJ1Q06148 TSC11YER093C 4293 nt2.83□□□□□ -1.96
NEJ1Q06148 BSC1YDL037C 987 nt2.83□□□□□ -1.96
NEJ1Q06148 tQ(UUG)BtQ(UUG)B 72 nt2.83□□□□□ -1.96
NEJ1Q06148 YKL071WYKL071W 771 nt2.83□□□□□ -1.96
NEJ1Q06148 ERG2YMR202W 669 nt2.83□□□□□ -1.96
NEJ1Q06148 MFA2YNL145W 117 nt2.83□□□□□ -1.96
NEJ1Q06148 YOL050CYOL050C 321 nt2.83□□□□□ -1.96
NEJ1Q06148 TMC1YOR052C 453 nt2.83□□□□□ -1.96
NEJ1Q06148 YBR053CYBR053C 1077 nt2.83□□□□□ -1.96
NEJ1Q06148 SRO9YCL037C 1305 nt2.83□□□□□ -1.96
NEJ1Q06148 NDT80YHR124W 1884 nt2.83□□□□□ -1.96
NEJ1Q06148 TFC4YGR047C 3078 nt2.83□□□□□ -1.96
NEJ1Q06148 YHL012WYHL012W 1482 nt2.83□□□□□ -1.96
NEJ1Q06148 ERG11YHR007C 1593 nt2.83□□□□□ -1.96
NEJ1Q06148 MDM1YML104C 3384 nt2.82□□□□□ -1.96
NEJ1Q06148 VPS27YNR006W 1869 nt2.82□□□□□ -1.96
NEJ1Q06148 INP52YNL106C 3552 nt2.82□□□□□ -1.96
NEJ1Q06148 NOP4YPL043W 2058 nt2.82□□□□□ -1.96
NEJ1Q06148 YCL075WYCL075W 441 nt2.82□□□□□ -1.96
NEJ1Q06148 TOS8YGL096W 831 nt2.82□□□□□ -1.96
NEJ1Q06148 YAL065CYAL065C 387 nt2.82□□□□□ -1.96
NEJ1Q06148 YET2YMR040W 483 nt2.82□□□□□ -1.96
NEJ1Q06148 SSU72YNL222W 621 nt2.82□□□□□ -1.96
NEJ1Q06148 NEM1YHR004C 1341 nt2.82□□□□□ -1.96
NEJ1Q06148 SAS4YDR181C 1446 nt2.82□□□□□ -1.96
NEJ1Q06148 CCM1YGR150C 2595 nt2.82□□□□□ -1.96
NEJ1Q06148 UBP12YJL197W 3765 nt2.82□□□□□ -1.96
NEJ1Q06148 CEP3YMR168C 1827 nt2.82□□□□□ -1.96
NEJ1Q06148 TAO3YIL129C 7131 nt2.81□□□□□ -1.96
NEJ1Q06148 LRG1YDL240W 3054 nt2.81□□□□□ -1.96
NEJ1Q06148 YGL214WYGL214W 486 nt2.81□□□□□ -1.96
NEJ1Q06148 RPS23AYGR118W 438 nt2.81□□□□□ -1.96
NEJ1Q06148 YKL177WYKL177W 339 nt2.81□□□□□ -1.96
NEJ1Q06148 YBL077WYBL077W 432 nt2.81□□□□□ -1.96
NEJ1Q06148 RPS23BYPR132W 438 nt2.81□□□□□ -1.96
NEJ1Q06148 SDS23YGL056C 1584 nt2.81□□□□□ -1.96
NEJ1Q06148 AIM14YGL160W 1713 nt2.81□□□□□ -1.96
NEJ1Q06148 CEX1YOR112W 2286 nt2.81□□□□□ -1.96
NEJ1Q06148 SRC1YML034W 2505 nt2.81□□□□□ -1.96
NEJ1Q06148 KAP104YBR017C 2757 nt2.81□□□□□ -1.96
NEJ1Q06148 YLR278CYLR278C 4026 nt2.81□□□□□ -1.96
NEJ1Q06148 DBP7YKR024C 2229 nt2.8□□□□□ -1.96
NEJ1Q06148 MIG1YGL035C 1515 nt2.8□□□□□ -1.96
NEJ1Q06148 snR57snR57 88 nt2.8□□□□□ -1.96
NEJ1Q06148 YDR282CYDR282C 1245 nt2.8□□□□□ -1.96
NEJ1Q06148 tK(UUU)DtK(UUU)D 73 nt2.8□□□□□ -1.96
NEJ1Q06148 tK(UUU)G1tK(UUU)G1 73 nt2.8□□□□□ -1.96
NEJ1Q06148 tK(UUU)G2tK(UUU)G2 73 nt2.8□□□□□ -1.96
NEJ1Q06148 tK(UUU)KtK(UUU)K 73 nt2.8□□□□□ -1.96
NEJ1Q06148 tK(UUU)LtK(UUU)L 73 nt2.8□□□□□ -1.96
NEJ1Q06148 tK(UUU)OtK(UUU)O 73 nt2.8□□□□□ -1.96
NEJ1Q06148 tK(UUU)PtK(UUU)P 73 nt2.8□□□□□ -1.96
NEJ1Q06148 SDT1YGL224C 843 nt2.8□□□□□ -1.96
NEJ1Q06148 CLC1YGR167W 702 nt2.8□□□□□ -1.96
NEJ1Q06148 PCD1YLR151C 1023 nt2.8□□□□□ -1.96
NEJ1Q06148 MRPL51YPR100W 423 nt2.8□□□□□ -1.96
NEJ1Q06148 NMD2YHR077C 3270 nt2.8□□□□□ -1.96
NEJ1Q06148 AKR1YDR264C 2295 nt2.8□□□□□ -1.96
NEJ1Q06148 RIF1YBR275C 5751 nt2.8□□□□□ -1.96
NEJ1Q06148 ECM29YHL030W 5607 nt2.79□□□□□ -1.96
NEJ1Q06148 BNA4YBL098W 1383 nt2.79□□□□□ -1.96
NEJ1Q06148 ISM1YPL040C 3009 nt2.79□□□□□ -1.96
NEJ1Q06148 GTF1YGR102C 552 nt2.79□□□□□ -1.96
NEJ1Q06148 FRE2YKL220C 2136 nt2.79□□□□□ -1.96
NEJ1Q06148 PEX11YOL147C 711 nt2.79□□□□□ -1.96
NEJ1Q06148 YHR202WYHR202W 1809 nt2.79□□□□□ -1.96
NEJ1Q06148 BUD6YLR319C 2367 nt2.79□□□□□ -1.96
NEJ1Q06148 CHK1YBR274W 1584 nt2.78□□□□□ -1.96
NEJ1Q06148 RSN1YMR266W 2862 nt2.78□□□□□ -1.96
NEJ1Q06148 RMT2YDR465C 1239 nt2.78□□□□□ -1.96
NEJ1Q06148 YHL005CYHL005C 393 nt2.78□□□□□ -1.96
NEJ1Q06148 SFH5YJL145W 885 nt2.78□□□□□ -1.96
NEJ1Q06148 CSM3YMR048W 954 nt2.78□□□□□ -1.96
NEJ1Q06148 OCA2YNL056W 594 nt2.78□□□□□ -1.96
NEJ1Q06148 AIM39YOL053W 1188 nt2.78□□□□□ -1.96
NEJ1Q06148 PSF3YOL146W 585 nt2.78□□□□□ -1.96
NEJ1Q06148 YOR314WYOR314W 330 nt2.78□□□□□ -1.96
NEJ1Q06148 MEF1YLR069C 2286 nt2.78□□□□□ -1.96
NEJ1Q06148 NTO1YPR031W 2247 nt2.78□□□□□ -1.96
NEJ1Q06148 SEC7YDR170C 6030 nt2.77□□□□□ -1.97
NEJ1Q06148 KIN3YAR018C 1308 nt2.77□□□□□ -1.97
NEJ1Q06148 RIM1YCR028C-A 408 nt2.77□□□□□ -1.97
NEJ1Q06148 BMH2YDR099W 822 nt2.77□□□□□ -1.97
NEJ1Q06148 FRQ1YDR373W 573 nt2.77□□□□□ -1.97
NEJ1Q06148 VMA8YEL051W 771 nt2.77□□□□□ -1.97
NEJ1Q06148 SPO16YHR153C 597 nt2.77□□□□□ -1.97
NEJ1Q06148 YLR297WYLR297W 390 nt2.77□□□□□ -1.97
NEJ1Q06148 SSO2YMR183C 888 nt2.77□□□□□ -1.97
NEJ1Q06148 STP1YDR463W 1560 nt2.77□□□□□ -1.97
NEJ1Q06148 ESL1YIL151C 3357 nt2.77□□□□□ -1.97
NEJ1Q06148 RAD7YJR052W 1698 nt2.76□□□□□ -1.97
NEJ1Q06148 PRM15YMR278W 1869 nt2.76□□□□□ -1.97
NEJ1Q06148 SEC15YGL233W 2733 nt2.76□□□□□ -1.97
NEJ1Q06148 CDC26YFR036W 375 nt2.76□□□□□ -1.97
NEJ1Q06148 FMC1YIL098C 468 nt2.76□□□□□ -1.97
NEJ1Q06148 YLR230WYLR230W 306 nt2.76□□□□□ -1.97
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