Protein–RNA interactions for Protein: Q06106

MRD1, Multiple RNA-binding domain-containing protein 1, yeast

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRD1	Q06106	SPP381	YBR152W	876 nt		3.96	□□□□□ -1.78
MRD1	Q06106	NUF2	YOL069W	1356 nt		3.96	□□□□□ -1.78
MRD1	Q06106	ACA1	YER045C	1470 nt		3.96	□□□□□ -1.78
MRD1	Q06106	AKR1	YDR264C	2295 nt		3.96	□□□□□ -1.78
MRD1	Q06106	YBR238C	YBR238C	2196 nt		3.95	□□□□□ -1.78
MRD1	Q06106	MAL12	YGR292W	1755 nt		3.95	□□□□□ -1.78
MRD1	Q06106	KRI1	YNL308C	1776 nt		3.95	□□□□□ -1.78
MRD1	Q06106	MAL32	YBR299W	1755 nt		3.95	□□□□□ -1.78
MRD1	Q06106	MRPL11	YDL202W	750 nt		3.95	□□□□□ -1.78
MRD1	Q06106	ERG20	YJL167W	1059 nt		3.95	□□□□□ -1.78
MRD1	Q06106	GAB1	YLR459W	1185 nt		3.95	□□□□□ -1.78
MRD1	Q06106	RPL18A	YOL120C	561 nt		3.95	□□□□□ -1.78
MRD1	Q06106	RPS11B	YBR048W	471 nt		3.95	□□□□□ -1.78
MRD1	Q06106	CSH1	YBR161W	1131 nt		3.95	□□□□□ -1.78
MRD1	Q06106	RSF2	YJR127C	4143 nt		3.94	□□□□□ -1.78
MRD1	Q06106	APN2	YBL019W	1563 nt		3.94	□□□□□ -1.78
MRD1	Q06106	TEC1	YBR083W	1461 nt		3.94	□□□□□ -1.78
MRD1	Q06106	AEP3	YPL005W	1821 nt		3.94	□□□□□ -1.78
MRD1	Q06106	IRC25	YLR021W	540 nt		3.94	□□□□□ -1.78
MRD1	Q06106	RUF21	RUF21	707 nt		3.94	□□□□□ -1.78
MRD1	Q06106	IST1	YNL265C	897 nt		3.94	□□□□□ -1.78
MRD1	Q06106	YOR263C	YOR263C	408 nt		3.94	□□□□□ -1.78
MRD1	Q06106	ERB1	YMR049C	2424 nt		3.94	□□□□□ -1.78
MRD1	Q06106	YNR063W	YNR063W	1824 nt		3.93	□□□□□ -1.78
MRD1	Q06106	DSN1	YIR010W	1731 nt		3.93	□□□□□ -1.78
MRD1	Q06106	YDR193W	YDR193W	399 nt		3.93	□□□□□ -1.78
MRD1	Q06106	OSH3	YHR073W	2991 nt		3.93	□□□□□ -1.78
MRD1	Q06106	FIP1	YJR093C	984 nt		3.93	□□□□□ -1.78
MRD1	Q06106	ARC19	YKL013C	516 nt		3.93	□□□□□ -1.78
MRD1	Q06106	YML047W-A	YML047W-A	366 nt		3.93	□□□□□ -1.78
MRD1	Q06106	ATG5	YPL149W	885 nt		3.93	□□□□□ -1.78
MRD1	Q06106	TAF1	YGR274C	3201 nt		3.93	□□□□□ -1.78
MRD1	Q06106	YGL140C	YGL140C	3660 nt		3.93	□□□□□ -1.78
MRD1	Q06106	DAN4	YJR151C	3486 nt		3.93	□□□□□ -1.78
MRD1	Q06106	ALA1	YOR335C	2877 nt		3.92	□□□□□ -1.78
MRD1	Q06106	SHQ1	YIL104C	1524 nt		3.92	□□□□□ -1.78
MRD1	Q06106	BSC2	YDR275W	708 nt		3.92	□□□□□ -1.78
MRD1	Q06106	YGR026W	YGR026W	837 nt		3.92	□□□□□ -1.78
MRD1	Q06106	YPT35	YHR105W	645 nt		3.92	□□□□□ -1.78
MRD1	Q06106	TRS120	YDR407C	3870 nt		3.92	□□□□□ -1.78
MRD1	Q06106	NAT1	YDL040C	2565 nt		3.91	□□□□□ -1.78
MRD1	Q06106	OPI6	YDL096C	327 nt		3.91	□□□□□ -1.78
MRD1	Q06106	PAU10	YDR542W	363 nt		3.91	□□□□□ -1.78
MRD1	Q06106	TCA17	YEL048C	459 nt		3.91	□□□□□ -1.78
MRD1	Q06106	SDS23	YGL056C	1584 nt		3.91	□□□□□ -1.78
MRD1	Q06106	PAU11	YGL261C	363 nt		3.91	□□□□□ -1.78
MRD1	Q06106	PAU13	YHL046C	363 nt		3.91	□□□□□ -1.78
MRD1	Q06106	CAP2	YIL034C	864 nt		3.91	□□□□□ -1.78
MRD1	Q06106	PAU4	YLR461W	363 nt		3.91	□□□□□ -1.78
MRD1	Q06106	YMR122W-A	YMR122W-A	255 nt		3.91	□□□□□ -1.78
MRD1	Q06106	AME1	YBR211C	975 nt		3.91	□□□□□ -1.78
MRD1	Q06106	MSR1	YHR091C	1932 nt		3.91	□□□□□ -1.78
MRD1	Q06106	UBP12	YJL197W	3765 nt		3.91	□□□□□ -1.78
MRD1	Q06106	MIC60	YKR016W	1623 nt		3.91	□□□□□ -1.78
MRD1	Q06106	MGA1	YGR249W	1371 nt		3.9	□□□□□ -1.78
MRD1	Q06106	ARO1	YDR127W	4767 nt		3.9	□□□□□ -1.78
MRD1	Q06106	YJR030C	YJR030C	2238 nt		3.9	□□□□□ -1.78
MRD1	Q06106	RNT1	YMR239C	1416 nt		3.9	□□□□□ -1.78
MRD1	Q06106	SHR3	YDL212W	633 nt		3.9	□□□□□ -1.79
MRD1	Q06106	RPS8B	YER102W	603 nt		3.9	□□□□□ -1.79
MRD1	Q06106	RPS8A	YBL072C	603 nt		3.9	□□□□□ -1.79
MRD1	Q06106	CAF20	YOR276W	486 nt		3.9	□□□□□ -1.79
MRD1	Q06106	YOR365C	YOR365C	2112 nt		3.9	□□□□□ -1.79
MRD1	Q06106	MRPL51	YPR100W	423 nt		3.9	□□□□□ -1.79
MRD1	Q06106	YBR096W	YBR096W	693 nt		3.9	□□□□□ -1.79
MRD1	Q06106	UTP25	YIL091C	2166 nt		3.9	□□□□□ -1.79
MRD1	Q06106	RPA135	YPR010C	3612 nt		3.9	□□□□□ -1.79
MRD1	Q06106	SEC6	YIL068C	2418 nt		3.9	□□□□□ -1.79
MRD1	Q06106	FUN12	YAL035W	3009 nt		3.89	□□□□□ -1.79
MRD1	Q06106	PLM2	YDR501W	1566 nt		3.89	□□□□□ -1.79
MRD1	Q06106	MRPL32	YCR003W	552 nt		3.89	□□□□□ -1.79
MRD1	Q06106	GRX3	YDR098C	858 nt		3.89	□□□□□ -1.79
MRD1	Q06106	AIM23	YJL131C	1071 nt		3.89	□□□□□ -1.79
MRD1	Q06106	RIF2	YLR453C	1188 nt		3.89	□□□□□ -1.79
MRD1	Q06106	YNL035C	YNL035C	1170 nt		3.89	□□□□□ -1.79
MRD1	Q06106	COS1	YNL336W	1146 nt		3.89	□□□□□ -1.79
MRD1	Q06106	EXO5	YBR163W	1758 nt		3.89	□□□□□ -1.79
MRD1	Q06106	LCB5	YLR260W	2064 nt		3.88	□□□□□ -1.79
MRD1	Q06106	ATG21	YPL100W	1491 nt		3.88	□□□□□ -1.79
MRD1	Q06106	PLP1	YDR183W	693 nt		3.88	□□□□□ -1.79
MRD1	Q06106	tK(UUU)D	tK(UUU)D	73 nt		3.88	□□□□□ -1.79
MRD1	Q06106	tK(UUU)G1	tK(UUU)G1	73 nt		3.88	□□□□□ -1.79
MRD1	Q06106	tK(UUU)G2	tK(UUU)G2	73 nt		3.88	□□□□□ -1.79
MRD1	Q06106	tK(UUU)K	tK(UUU)K	73 nt		3.88	□□□□□ -1.79
MRD1	Q06106	tK(UUU)L	tK(UUU)L	73 nt		3.88	□□□□□ -1.79
MRD1	Q06106	tK(UUU)O	tK(UUU)O	73 nt		3.88	□□□□□ -1.79
MRD1	Q06106	tK(UUU)P	tK(UUU)P	73 nt		3.88	□□□□□ -1.79
MRD1	Q06106	YKL162C	YKL162C	1209 nt		3.88	□□□□□ -1.79
MRD1	Q06106	YLR163W-A	YLR163W-A	114 nt		3.88	□□□□□ -1.79
MRD1	Q06106	RPL19B	YBL027W	570 nt		3.88	□□□□□ -1.79
MRD1	Q06106	SSO2	YMR183C	888 nt		3.88	□□□□□ -1.79
MRD1	Q06106	SYC1	YOR179C	567 nt		3.88	□□□□□ -1.79
MRD1	Q06106	YBR242W	YBR242W	717 nt		3.88	□□□□□ -1.79
MRD1	Q06106	MSS4	YDR208W	2340 nt		3.88	□□□□□ -1.79
MRD1	Q06106	YIG1	YPL201C	1386 nt		3.88	□□□□□ -1.79
MRD1	Q06106	NSP1	YJL041W	2472 nt		3.87	□□□□□ -1.79
MRD1	Q06106	NUP85	YJR042W	2235 nt		3.87	□□□□□ -1.79
MRD1	Q06106	MNT4	YNR059W	1743 nt		3.87	□□□□□ -1.79
MRD1	Q06106	EPO1	YMR124W	2832 nt		3.87	□□□□□ -1.79
MRD1	Q06106	URA2	YJL130C	6645 nt		3.87	□□□□□ -1.79

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.8 ms