Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPCQ03188 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPCQ03188 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPCQ03188 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPCQ03188 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPCQ03188 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPCQ03188 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPCQ03188 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPCQ03188 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPCQ03188 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPCQ03188 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPCQ03188 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPCQ03188 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPCQ03188 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPCQ03188 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPCQ03188 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPCQ03188 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPCQ03188 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPCQ03188 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPCQ03188 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPCQ03188 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPCQ03188 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPCQ03188 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPCQ03188 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPCQ03188 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPCQ03188 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPCQ03188 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPCQ03188 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPCQ03188 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPCQ03188 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPCQ03188 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPCQ03188 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPCQ03188 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPCQ03188 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPCQ03188 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPCQ03188 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPCQ03188 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPCQ03188 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPCQ03188 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPCQ03188 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPCQ03188 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPCQ03188 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPCQ03188 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPCQ03188 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPCQ03188 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPCQ03188 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPCQ03188 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPCQ03188 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPCQ03188 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPCQ03188 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPCQ03188 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPCQ03188 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPCQ03188 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPCQ03188 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPCQ03188 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPCQ03188 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPCQ03188 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPCQ03188 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPCQ03188 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPCQ03188 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPCQ03188 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPCQ03188 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPCQ03188 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPCQ03188 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPCQ03188 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPCQ03188 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPCQ03188 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPCQ03188 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPCQ03188 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPCQ03188 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPCQ03188 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPCQ03188 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPCQ03188 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPCQ03188 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPCQ03188 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPCQ03188 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPCQ03188 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPCQ03188 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPCQ03188 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPCQ03188 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPCQ03188 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPCQ03188 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPCQ03188 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPCQ03188 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPCQ03188 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPCQ03188 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPCQ03188 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPCQ03188 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPCQ03188 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPCQ03188 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPCQ03188 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPCQ03188 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPCQ03188 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPCQ03188 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPCQ03188 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPCQ03188 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPCQ03188 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPCQ03188 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPCQ03188 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPCQ03188 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms