Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EXOSC10Q01780 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EXOSC10Q01780 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EXOSC10Q01780 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EXOSC10Q01780 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EXOSC10Q01780 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EXOSC10Q01780 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EXOSC10Q01780 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EXOSC10Q01780 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EXOSC10Q01780 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EXOSC10Q01780 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EXOSC10Q01780 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
EXOSC10Q01780 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
EXOSC10Q01780 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EXOSC10Q01780 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EXOSC10Q01780 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EXOSC10Q01780 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EXOSC10Q01780 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EXOSC10Q01780 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EXOSC10Q01780 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EXOSC10Q01780 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EXOSC10Q01780 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EXOSC10Q01780 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EXOSC10Q01780 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EXOSC10Q01780 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EXOSC10Q01780 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EXOSC10Q01780 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EXOSC10Q01780 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EXOSC10Q01780 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EXOSC10Q01780 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EXOSC10Q01780 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EXOSC10Q01780 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EXOSC10Q01780 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EXOSC10Q01780 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EXOSC10Q01780 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EXOSC10Q01780 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EXOSC10Q01780 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EXOSC10Q01780 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EXOSC10Q01780 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EXOSC10Q01780 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EXOSC10Q01780 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EXOSC10Q01780 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EXOSC10Q01780 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EXOSC10Q01780 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EXOSC10Q01780 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EXOSC10Q01780 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EXOSC10Q01780 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EXOSC10Q01780 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EXOSC10Q01780 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EXOSC10Q01780 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EXOSC10Q01780 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EXOSC10Q01780 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EXOSC10Q01780 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EXOSC10Q01780 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EXOSC10Q01780 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EXOSC10Q01780 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EXOSC10Q01780 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EXOSC10Q01780 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
EXOSC10Q01780 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EXOSC10Q01780 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EXOSC10Q01780 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EXOSC10Q01780 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EXOSC10Q01780 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EXOSC10Q01780 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EXOSC10Q01780 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EXOSC10Q01780 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EXOSC10Q01780 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EXOSC10Q01780 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EXOSC10Q01780 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EXOSC10Q01780 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EXOSC10Q01780 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
EXOSC10Q01780 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EXOSC10Q01780 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EXOSC10Q01780 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EXOSC10Q01780 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EXOSC10Q01780 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EXOSC10Q01780 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EXOSC10Q01780 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EXOSC10Q01780 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EXOSC10Q01780 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EXOSC10Q01780 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EXOSC10Q01780 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EXOSC10Q01780 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EXOSC10Q01780 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EXOSC10Q01780 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EXOSC10Q01780 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EXOSC10Q01780 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EXOSC10Q01780 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EXOSC10Q01780 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EXOSC10Q01780 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
EXOSC10Q01780 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EXOSC10Q01780 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EXOSC10Q01780 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
EXOSC10Q01780 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EXOSC10Q01780 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EXOSC10Q01780 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EXOSC10Q01780 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EXOSC10Q01780 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EXOSC10Q01780 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
EXOSC10Q01780 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms