Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2BQ00403 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2BQ00403 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2BQ00403 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2BQ00403 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2BQ00403 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2BQ00403 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2BQ00403 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2BQ00403 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2BQ00403 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2BQ00403 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2BQ00403 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2BQ00403 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2BQ00403 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2BQ00403 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2BQ00403 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2BQ00403 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2BQ00403 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2BQ00403 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2BQ00403 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2BQ00403 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2BQ00403 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2BQ00403 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2BQ00403 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2BQ00403 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2BQ00403 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2BQ00403 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2BQ00403 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2BQ00403 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2BQ00403 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2BQ00403 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2BQ00403 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2BQ00403 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2BQ00403 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2BQ00403 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2BQ00403 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2BQ00403 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2BQ00403 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2BQ00403 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2BQ00403 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2BQ00403 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2BQ00403 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2BQ00403 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2BQ00403 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2BQ00403 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2BQ00403 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2BQ00403 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2BQ00403 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2BQ00403 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2BQ00403 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2BQ00403 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2BQ00403 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2BQ00403 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2BQ00403 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2BQ00403 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2BQ00403 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2BQ00403 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2BQ00403 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2BQ00403 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2BQ00403 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2BQ00403 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2BQ00403 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2BQ00403 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2BQ00403 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2BQ00403 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2BQ00403 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2BQ00403 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2BQ00403 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2BQ00403 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2BQ00403 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2BQ00403 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2BQ00403 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2BQ00403 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2BQ00403 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2BQ00403 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2BQ00403 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2BQ00403 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2BQ00403 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2BQ00403 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2BQ00403 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2BQ00403 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2BQ00403 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2BQ00403 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2BQ00403 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2BQ00403 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2BQ00403 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2BQ00403 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2BQ00403 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2BQ00403 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2BQ00403 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2BQ00403 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2BQ00403 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2BQ00403 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2BQ00403 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2BQ00403 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2BQ00403 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2BQ00403 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2BQ00403 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2BQ00403 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2BQ00403 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms