Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PITX1P78337 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PITX1P78337 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PITX1P78337 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PITX1P78337 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PITX1P78337 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PITX1P78337 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PITX1P78337 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PITX1P78337 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PITX1P78337 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PITX1P78337 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PITX1P78337 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PITX1P78337 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PITX1P78337 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PITX1P78337 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PITX1P78337 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PITX1P78337 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PITX1P78337 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PITX1P78337 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PITX1P78337 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PITX1P78337 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PITX1P78337 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PITX1P78337 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PITX1P78337 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PITX1P78337 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PITX1P78337 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PITX1P78337 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PITX1P78337 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PITX1P78337 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PITX1P78337 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PITX1P78337 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PITX1P78337 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PITX1P78337 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PITX1P78337 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PITX1P78337 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PITX1P78337 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PITX1P78337 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PITX1P78337 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PITX1P78337 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PITX1P78337 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PITX1P78337 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PITX1P78337 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PITX1P78337 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PITX1P78337 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PITX1P78337 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PITX1P78337 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PITX1P78337 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PITX1P78337 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PITX1P78337 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PITX1P78337 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PITX1P78337 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PITX1P78337 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PITX1P78337 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PITX1P78337 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PITX1P78337 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PITX1P78337 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PITX1P78337 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PITX1P78337 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PITX1P78337 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PITX1P78337 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PITX1P78337 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PITX1P78337 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PITX1P78337 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PITX1P78337 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PITX1P78337 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PITX1P78337 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PITX1P78337 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PITX1P78337 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PITX1P78337 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PITX1P78337 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PITX1P78337 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PITX1P78337 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PITX1P78337 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PITX1P78337 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PITX1P78337 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PITX1P78337 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PITX1P78337 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PITX1P78337 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PITX1P78337 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PITX1P78337 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PITX1P78337 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PITX1P78337 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PITX1P78337 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PITX1P78337 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PITX1P78337 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PITX1P78337 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PITX1P78337 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PITX1P78337 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PITX1P78337 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PITX1P78337 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PITX1P78337 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PITX1P78337 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PITX1P78337 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PITX1P78337 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PITX1P78337 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PITX1P78337 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PITX1P78337 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PITX1P78337 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PITX1P78337 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PITX1P78337 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms