Protein–RNA interactions for Protein: P78333

GPC5, Glypican-5, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC5P78333 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GPC5P78333 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GPC5P78333 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPC5P78333 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPC5P78333 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPC5P78333 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPC5P78333 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPC5P78333 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPC5P78333 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPC5P78333 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPC5P78333 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPC5P78333 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPC5P78333 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GPC5P78333 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPC5P78333 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPC5P78333 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPC5P78333 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPC5P78333 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPC5P78333 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPC5P78333 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPC5P78333 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPC5P78333 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPC5P78333 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPC5P78333 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPC5P78333 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPC5P78333 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPC5P78333 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPC5P78333 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPC5P78333 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPC5P78333 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GPC5P78333 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPC5P78333 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPC5P78333 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPC5P78333 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPC5P78333 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPC5P78333 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPC5P78333 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPC5P78333 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPC5P78333 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPC5P78333 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPC5P78333 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPC5P78333 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPC5P78333 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPC5P78333 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPC5P78333 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPC5P78333 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPC5P78333 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPC5P78333 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPC5P78333 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPC5P78333 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPC5P78333 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPC5P78333 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPC5P78333 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPC5P78333 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPC5P78333 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPC5P78333 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPC5P78333 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPC5P78333 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPC5P78333 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPC5P78333 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPC5P78333 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPC5P78333 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPC5P78333 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPC5P78333 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPC5P78333 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPC5P78333 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPC5P78333 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPC5P78333 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPC5P78333 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPC5P78333 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPC5P78333 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPC5P78333 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPC5P78333 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPC5P78333 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPC5P78333 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPC5P78333 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPC5P78333 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPC5P78333 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPC5P78333 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPC5P78333 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPC5P78333 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPC5P78333 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPC5P78333 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GPC5P78333 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPC5P78333 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPC5P78333 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPC5P78333 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPC5P78333 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPC5P78333 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPC5P78333 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPC5P78333 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPC5P78333 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPC5P78333 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPC5P78333 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPC5P78333 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPC5P78333 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPC5P78333 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPC5P78333 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPC5P78333 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPC5P78333 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms