Protein–RNA interactions for Protein: P62318

SNRPD3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD3P62318 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNRPD3P62318 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNRPD3P62318 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNRPD3P62318 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNRPD3P62318 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNRPD3P62318 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNRPD3P62318 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNRPD3P62318 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNRPD3P62318 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNRPD3P62318 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNRPD3P62318 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNRPD3P62318 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SNRPD3P62318 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNRPD3P62318 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SNRPD3P62318 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNRPD3P62318 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNRPD3P62318 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNRPD3P62318 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNRPD3P62318 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNRPD3P62318 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNRPD3P62318 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNRPD3P62318 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNRPD3P62318 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPD3P62318 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPD3P62318 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPD3P62318 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPD3P62318 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPD3P62318 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPD3P62318 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPD3P62318 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPD3P62318 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPD3P62318 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPD3P62318 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPD3P62318 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPD3P62318 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPD3P62318 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPD3P62318 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPD3P62318 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPD3P62318 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPD3P62318 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPD3P62318 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPD3P62318 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPD3P62318 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPD3P62318 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPD3P62318 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPD3P62318 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPD3P62318 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPD3P62318 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPD3P62318 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPD3P62318 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPD3P62318 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPD3P62318 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPD3P62318 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPD3P62318 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPD3P62318 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPD3P62318 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPD3P62318 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPD3P62318 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPD3P62318 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPD3P62318 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPD3P62318 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPD3P62318 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPD3P62318 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPD3P62318 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPD3P62318 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPD3P62318 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPD3P62318 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPD3P62318 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPD3P62318 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPD3P62318 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPD3P62318 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPD3P62318 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPD3P62318 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPD3P62318 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPD3P62318 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPD3P62318 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPD3P62318 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPD3P62318 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPD3P62318 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPD3P62318 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPD3P62318 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPD3P62318 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPD3P62318 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPD3P62318 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPD3P62318 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPD3P62318 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPD3P62318 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPD3P62318 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPD3P62318 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPD3P62318 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPD3P62318 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPD3P62318 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPD3P62318 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPD3P62318 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPD3P62318 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPD3P62318 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPD3P62318 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPD3P62318 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPD3P62318 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPD3P62318 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms