Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ActbP60710 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ActbP60710 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ActbP60710 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ActbP60710 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ActbP60710 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ActbP60710 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ActbP60710 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ActbP60710 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ActbP60710 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ActbP60710 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ActbP60710 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ActbP60710 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ActbP60710 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ActbP60710 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ActbP60710 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ActbP60710 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ActbP60710 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ActbP60710 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ActbP60710 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ActbP60710 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ActbP60710 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ActbP60710 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ActbP60710 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ActbP60710 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ActbP60710 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ActbP60710 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ActbP60710 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ActbP60710 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ActbP60710 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ActbP60710 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ActbP60710 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ActbP60710 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ActbP60710 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ActbP60710 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ActbP60710 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ActbP60710 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ActbP60710 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
ActbP60710 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ActbP60710 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ActbP60710 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ActbP60710 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ActbP60710 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ActbP60710 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ActbP60710 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ActbP60710 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ActbP60710 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ActbP60710 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ActbP60710 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ActbP60710 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ActbP60710 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ActbP60710 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ActbP60710 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ActbP60710 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ActbP60710 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ActbP60710 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ActbP60710 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ActbP60710 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ActbP60710 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ActbP60710 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ActbP60710 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ActbP60710 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ActbP60710 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ActbP60710 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ActbP60710 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ActbP60710 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ActbP60710 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ActbP60710 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ActbP60710 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ActbP60710 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ActbP60710 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ActbP60710 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ActbP60710 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ActbP60710 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ActbP60710 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ActbP60710 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ActbP60710 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ActbP60710 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ActbP60710 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ActbP60710 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ActbP60710 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ActbP60710 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ActbP60710 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ActbP60710 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ActbP60710 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ActbP60710 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ActbP60710 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ActbP60710 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ActbP60710 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ActbP60710 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ActbP60710 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ActbP60710 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ActbP60710 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ActbP60710 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ActbP60710 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ActbP60710 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ActbP60710 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ActbP60710 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ActbP60710 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ActbP60710 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms