Protein–RNA interactions for Protein: P60606

CTXN1, Cortexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN1P60606 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTXN1P60606 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTXN1P60606 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTXN1P60606 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTXN1P60606 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTXN1P60606 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTXN1P60606 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTXN1P60606 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTXN1P60606 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTXN1P60606 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTXN1P60606 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTXN1P60606 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTXN1P60606 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CTXN1P60606 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTXN1P60606 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTXN1P60606 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTXN1P60606 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTXN1P60606 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTXN1P60606 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTXN1P60606 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTXN1P60606 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTXN1P60606 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CTXN1P60606 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTXN1P60606 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTXN1P60606 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CTXN1P60606 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTXN1P60606 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTXN1P60606 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTXN1P60606 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTXN1P60606 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTXN1P60606 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTXN1P60606 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTXN1P60606 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTXN1P60606 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTXN1P60606 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTXN1P60606 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTXN1P60606 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTXN1P60606 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTXN1P60606 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTXN1P60606 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTXN1P60606 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTXN1P60606 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTXN1P60606 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTXN1P60606 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTXN1P60606 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTXN1P60606 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTXN1P60606 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTXN1P60606 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTXN1P60606 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTXN1P60606 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTXN1P60606 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTXN1P60606 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTXN1P60606 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTXN1P60606 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTXN1P60606 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTXN1P60606 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTXN1P60606 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTXN1P60606 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CTXN1P60606 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTXN1P60606 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTXN1P60606 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTXN1P60606 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTXN1P60606 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTXN1P60606 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTXN1P60606 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTXN1P60606 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTXN1P60606 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTXN1P60606 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTXN1P60606 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTXN1P60606 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTXN1P60606 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CTXN1P60606 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTXN1P60606 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CTXN1P60606 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTXN1P60606 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTXN1P60606 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTXN1P60606 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTXN1P60606 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTXN1P60606 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTXN1P60606 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTXN1P60606 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTXN1P60606 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTXN1P60606 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTXN1P60606 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTXN1P60606 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTXN1P60606 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTXN1P60606 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTXN1P60606 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTXN1P60606 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTXN1P60606 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTXN1P60606 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTXN1P60606 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTXN1P60606 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTXN1P60606 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTXN1P60606 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTXN1P60606 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTXN1P60606 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTXN1P60606 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CTXN1P60606 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CTXN1P60606 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms