Protein–RNA interactions for Protein: P54762

EPHB1, Ephrin type-B receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 984 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB1P54762 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
EPHB1P54762 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EPHB1P54762 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EPHB1P54762 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EPHB1P54762 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EPHB1P54762 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EPHB1P54762 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EPHB1P54762 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EPHB1P54762 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EPHB1P54762 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EPHB1P54762 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EPHB1P54762 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EPHB1P54762 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EPHB1P54762 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EPHB1P54762 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EPHB1P54762 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EPHB1P54762 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EPHB1P54762 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
EPHB1P54762 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
EPHB1P54762 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
EPHB1P54762 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EPHB1P54762 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EPHB1P54762 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EPHB1P54762 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EPHB1P54762 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EPHB1P54762 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EPHB1P54762 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EPHB1P54762 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EPHB1P54762 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EPHB1P54762 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EPHB1P54762 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EPHB1P54762 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EPHB1P54762 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EPHB1P54762 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EPHB1P54762 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EPHB1P54762 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EPHB1P54762 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EPHB1P54762 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
EPHB1P54762 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EPHB1P54762 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EPHB1P54762 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EPHB1P54762 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EPHB1P54762 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EPHB1P54762 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EPHB1P54762 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EPHB1P54762 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EPHB1P54762 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EPHB1P54762 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EPHB1P54762 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EPHB1P54762 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EPHB1P54762 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EPHB1P54762 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EPHB1P54762 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EPHB1P54762 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EPHB1P54762 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EPHB1P54762 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EPHB1P54762 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EPHB1P54762 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EPHB1P54762 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EPHB1P54762 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EPHB1P54762 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EPHB1P54762 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EPHB1P54762 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EPHB1P54762 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EPHB1P54762 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EPHB1P54762 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EPHB1P54762 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EPHB1P54762 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EPHB1P54762 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EPHB1P54762 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EPHB1P54762 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EPHB1P54762 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EPHB1P54762 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EPHB1P54762 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EPHB1P54762 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EPHB1P54762 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EPHB1P54762 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EPHB1P54762 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
EPHB1P54762 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EPHB1P54762 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EPHB1P54762 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EPHB1P54762 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EPHB1P54762 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EPHB1P54762 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EPHB1P54762 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EPHB1P54762 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EPHB1P54762 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EPHB1P54762 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EPHB1P54762 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EPHB1P54762 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EPHB1P54762 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EPHB1P54762 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EPHB1P54762 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EPHB1P54762 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EPHB1P54762 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EPHB1P54762 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EPHB1P54762 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
EPHB1P54762 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EPHB1P54762 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
EPHB1P54762 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms