Protein–RNA interactions for Protein: P54253

ATXN1, Ataxin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN1P54253 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATXN1P54253 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATXN1P54253 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATXN1P54253 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATXN1P54253 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATXN1P54253 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATXN1P54253 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATXN1P54253 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATXN1P54253 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATXN1P54253 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATXN1P54253 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATXN1P54253 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATXN1P54253 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATXN1P54253 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATXN1P54253 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATXN1P54253 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATXN1P54253 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATXN1P54253 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATXN1P54253 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATXN1P54253 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATXN1P54253 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATXN1P54253 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATXN1P54253 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATXN1P54253 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATXN1P54253 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATXN1P54253 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATXN1P54253 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATXN1P54253 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATXN1P54253 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATXN1P54253 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATXN1P54253 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATXN1P54253 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATXN1P54253 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATXN1P54253 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATXN1P54253 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATXN1P54253 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATXN1P54253 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATXN1P54253 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATXN1P54253 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATXN1P54253 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATXN1P54253 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATXN1P54253 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATXN1P54253 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATXN1P54253 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATXN1P54253 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATXN1P54253 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATXN1P54253 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATXN1P54253 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ATXN1P54253 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ATXN1P54253 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATXN1P54253 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATXN1P54253 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATXN1P54253 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATXN1P54253 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATXN1P54253 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATXN1P54253 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATXN1P54253 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATXN1P54253 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATXN1P54253 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATXN1P54253 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATXN1P54253 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATXN1P54253 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATXN1P54253 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATXN1P54253 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATXN1P54253 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATXN1P54253 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ATXN1P54253 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATXN1P54253 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATXN1P54253 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATXN1P54253 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATXN1P54253 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATXN1P54253 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATXN1P54253 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ATXN1P54253 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATXN1P54253 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATXN1P54253 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATXN1P54253 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATXN1P54253 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATXN1P54253 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATXN1P54253 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ATXN1P54253 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATXN1P54253 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATXN1P54253 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATXN1P54253 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATXN1P54253 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
ATXN1P54253 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATXN1P54253 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATXN1P54253 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATXN1P54253 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ATXN1P54253 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATXN1P54253 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATXN1P54253 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATXN1P54253 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATXN1P54253 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATXN1P54253 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATXN1P54253 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATXN1P54253 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATXN1P54253 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATXN1P54253 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATXN1P54253 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms