Protein–RNA interactions for Protein: P54136

RARS, Arginine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARSP54136 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RARSP54136 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RARSP54136 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RARSP54136 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RARSP54136 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RARSP54136 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RARSP54136 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RARSP54136 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RARSP54136 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RARSP54136 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RARSP54136 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RARSP54136 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RARSP54136 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RARSP54136 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RARSP54136 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RARSP54136 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RARSP54136 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RARSP54136 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RARSP54136 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RARSP54136 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RARSP54136 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RARSP54136 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RARSP54136 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RARSP54136 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RARSP54136 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RARSP54136 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RARSP54136 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RARSP54136 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RARSP54136 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RARSP54136 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RARSP54136 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RARSP54136 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RARSP54136 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
RARSP54136 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RARSP54136 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RARSP54136 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RARSP54136 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RARSP54136 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RARSP54136 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RARSP54136 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RARSP54136 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RARSP54136 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RARSP54136 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RARSP54136 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RARSP54136 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
RARSP54136 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RARSP54136 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RARSP54136 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RARSP54136 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RARSP54136 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RARSP54136 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RARSP54136 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RARSP54136 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RARSP54136 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RARSP54136 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RARSP54136 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RARSP54136 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RARSP54136 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RARSP54136 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RARSP54136 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RARSP54136 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RARSP54136 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RARSP54136 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RARSP54136 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RARSP54136 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RARSP54136 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RARSP54136 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RARSP54136 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RARSP54136 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RARSP54136 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RARSP54136 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RARSP54136 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RARSP54136 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RARSP54136 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
RARSP54136 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC27.56■■■□□ 2
RARSP54136 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.56■■■□□ 2
RARSP54136 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RARSP54136 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RARSP54136 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RARSP54136 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RARSP54136 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
RARSP54136 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RARSP54136 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
RARSP54136 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RARSP54136 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RARSP54136 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RARSP54136 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RARSP54136 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RARSP54136 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RARSP54136 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
RARSP54136 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RARSP54136 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RARSP54136 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RARSP54136 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
RARSP54136 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RARSP54136 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC27.54■■■□□ 2
RARSP54136 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RARSP54136 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RARSP54136 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RARSP54136 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms