Protein–RNA interactions for Protein: P53847

DSL1, Protein transport protein DSL1, yeast

Predictions only

Length 754 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DSL1	P53847	FYV6	YNL133C	522 nt		3.64	□□□□□ -1.83
DSL1	P53847	YNR042W	YNR042W	429 nt		3.64	□□□□□ -1.83
DSL1	P53847	TAF3	YPL011C	1062 nt		3.64	□□□□□ -1.83
DSL1	P53847	YBR096W	YBR096W	693 nt		3.64	□□□□□ -1.83
DSL1	P53847	MTH1	YDR277C	1302 nt		3.64	□□□□□ -1.83
DSL1	P53847	SUP45	YBR143C	1314 nt		3.64	□□□□□ -1.83
DSL1	P53847	PRP3	YDR473C	1410 nt		3.63	□□□□□ -1.83
DSL1	P53847	QRI7	YDL104C	1224 nt		3.63	□□□□□ -1.83
DSL1	P53847	YDL228C	YDL228C	642 nt		3.63	□□□□□ -1.83
DSL1	P53847	GRX3	YDR098C	858 nt		3.63	□□□□□ -1.83
DSL1	P53847	YGL177W	YGL177W	348 nt		3.63	□□□□□ -1.83
DSL1	P53847	YHR173C	YHR173C	339 nt		3.63	□□□□□ -1.83
DSL1	P53847	POG1	YIL122W	1056 nt		3.63	□□□□□ -1.83
DSL1	P53847	DIA1	YMR316W	1011 nt		3.63	□□□□□ -1.83
DSL1	P53847	YNL035C	YNL035C	1170 nt		3.63	□□□□□ -1.83
DSL1	P53847	ATG34	YOL083W	1239 nt		3.63	□□□□□ -1.83
DSL1	P53847	UBX5	YDR330W	1503 nt		3.62	□□□□□ -1.83
DSL1	P53847	YCR075W-A	YCR075W-A	228 nt		3.62	□□□□□ -1.83
DSL1	P53847	FAD1	YDL045C	921 nt		3.62	□□□□□ -1.83
DSL1	P53847	AIM7	YDR063W	450 nt		3.62	□□□□□ -1.83
DSL1	P53847	RAD55	YDR076W	1221 nt		3.62	□□□□□ -1.83
DSL1	P53847	IZH1	YDR492W	951 nt		3.62	□□□□□ -1.83
DSL1	P53847	YER039C-A	YER039C-A	219 nt		3.62	□□□□□ -1.83
DSL1	P53847	YGL006W-A	YGL006W-A	111 nt		3.62	□□□□□ -1.83
DSL1	P53847	GEP7	YGL057C	864 nt		3.62	□□□□□ -1.83
DSL1	P53847	HTD2	YHR067W	843 nt		3.62	□□□□□ -1.83
DSL1	P53847	YIL156W-A	YIL156W-A	402 nt		3.62	□□□□□ -1.83
DSL1	P53847	YIR040C	YIR040C	333 nt		3.62	□□□□□ -1.83
DSL1	P53847	VPS25	YJR102C	609 nt		3.62	□□□□□ -1.83
DSL1	P53847	AUR1	YKL004W	1206 nt		3.62	□□□□□ -1.83
DSL1	P53847	BOS1	YLR078C	735 nt		3.62	□□□□□ -1.83
DSL1	P53847	YBL062W	YBL062W	381 nt		3.62	□□□□□ -1.83
DSL1	P53847	UFE1	YOR075W	1041 nt		3.62	□□□□□ -1.83
DSL1	P53847	YPR077C	YPR077C	372 nt		3.62	□□□□□ -1.83
DSL1	P53847	MRPL51	YPR100W	423 nt		3.62	□□□□□ -1.83
DSL1	P53847	BMS1	YPL217C	3552 nt		3.62	□□□□□ -1.83
DSL1	P53847	FAR8	YMR029C	1572 nt		3.62	□□□□□ -1.83
DSL1	P53847	TRM12	YML005W	1389 nt		3.62	□□□□□ -1.83
DSL1	P53847	NOG1	YPL093W	1944 nt		3.62	□□□□□ -1.83
DSL1	P53847	SLM2	YNL047C	1971 nt		3.62	□□□□□ -1.83
DSL1	P53847	DSN1	YIR010W	1731 nt		3.61	□□□□□ -1.83
DSL1	P53847	LCB5	YLR260W	2064 nt		3.61	□□□□□ -1.83
DSL1	P53847	RSC1	YGR056W	2787 nt		3.61	□□□□□ -1.83
DSL1	P53847	ASI1	YMR119W	1875 nt		3.61	□□□□□ -1.83
DSL1	P53847	VPS27	YNR006W	1869 nt		3.61	□□□□□ -1.83
DSL1	P53847	SPT15	YER148W	723 nt		3.61	□□□□□ -1.83
DSL1	P53847	YIR021W-A	YIR021W-A	213 nt		3.61	□□□□□ -1.83
DSL1	P53847	UBC12	YLR306W	567 nt		3.61	□□□□□ -1.83
DSL1	P53847	YAR075W	YAR075W	474 nt		3.61	□□□□□ -1.83
DSL1	P53847	RUF21	RUF21	707 nt		3.61	□□□□□ -1.83
DSL1	P53847	SIL1	YOL031C	1266 nt		3.61	□□□□□ -1.83
DSL1	P53847	VAM10	YOR068C	345 nt		3.61	□□□□□ -1.83
DSL1	P53847	OSW1	YOR255W	837 nt		3.61	□□□□□ -1.83
DSL1	P53847	BTS1	YPL069C	1008 nt		3.61	□□□□□ -1.83
DSL1	P53847	CCL1	YPR025C	1182 nt		3.61	□□□□□ -1.83
DSL1	P53847	TPD3	YAL016W	1908 nt		3.61	□□□□□ -1.83
DSL1	P53847	CPR1	YDR155C	489 nt		3.6	□□□□□ -1.83
DSL1	P53847	AHA1	YDR214W	1053 nt		3.6	□□□□□ -1.83
DSL1	P53847	YDR535C	YDR535C	501 nt		3.6	□□□□□ -1.83
DSL1	P53847	USE1	YGL098W	738 nt		3.6	□□□□□ -1.83
DSL1	P53847	PEX14	YGL153W	1026 nt		3.6	□□□□□ -1.83
DSL1	P53847	YGR270C-A	YGR270C-A	219 nt		3.6	□□□□□ -1.83
DSL1	P53847	YHR032C-A	YHR032C-A	120 nt		3.6	□□□□□ -1.83
DSL1	P53847	YJR128W	YJR128W	360 nt		3.6	□□□□□ -1.83
DSL1	P53847	CMC1	YKL137W	336 nt		3.6	□□□□□ -1.83
DSL1	P53847	YAL064W	YAL064W	285 nt		3.6	□□□□□ -1.83
DSL1	P53847	YNL226W	YNL226W	411 nt		3.6	□□□□□ -1.83
DSL1	P53847	YNL319W	YNL319W	441 nt		3.6	□□□□□ -1.83
DSL1	P53847	IRC13	YOR235W	315 nt		3.6	□□□□□ -1.83
DSL1	P53847	CAF20	YOR276W	486 nt		3.6	□□□□□ -1.83
DSL1	P53847	PEP4	YPL154C	1218 nt		3.6	□□□□□ -1.83
DSL1	P53847	HPA2	YPR193C	471 nt		3.6	□□□□□ -1.83
DSL1	P53847	RTT109	YLL002W	1311 nt		3.6	□□□□□ -1.83
DSL1	P53847	FRT2	YAL028W	1587 nt		3.59	□□□□□ -1.83
DSL1	P53847	SET1	YHR119W	3243 nt		3.59	□□□□□ -1.83
DSL1	P53847	IMH1	YLR309C	2736 nt		3.59	□□□□□ -1.83
DSL1	P53847	YPS7	YDR349C	1791 nt		3.59	□□□□□ -1.83
DSL1	P53847	KIN4	YOR233W	2403 nt		3.59	□□□□□ -1.83
DSL1	P53847	YDR355C	YDR355C	303 nt		3.59	□□□□□ -1.83
DSL1	P53847	YFL051C	YFL051C	483 nt		3.59	□□□□□ -1.83
DSL1	P53847	PFS1	YHR185C	714 nt		3.59	□□□□□ -1.83
DSL1	P53847	POL32	YJR043C	1053 nt		3.59	□□□□□ -1.83
DSL1	P53847	YKL162C-A	YKL162C-A	153 nt		3.59	□□□□□ -1.83
DSL1	P53847	GAT3	YLR013W	426 nt		3.59	□□□□□ -1.83
DSL1	P53847	RPS28B	YLR264W	204 nt		3.59	□□□□□ -1.83
DSL1	P53847	TRI1	YMR233W	681 nt		3.59	□□□□□ -1.83
DSL1	P53847	MEI4	YER044C-A	1227 nt		3.58	□□□□□ -1.84
DSL1	P53847	PET130	YJL023C	1044 nt		3.58	□□□□□ -1.84
DSL1	P53847	YAL064W-B	YAL064W-B	381 nt		3.58	□□□□□ -1.84
DSL1	P53847	SHH3	YMR118C	591 nt		3.58	□□□□□ -1.84
DSL1	P53847	DUG3	YNL191W	1074 nt		3.58	□□□□□ -1.84
DSL1	P53847	MRPL27	YBR282W	441 nt		3.58	□□□□□ -1.84
DSL1	P53847	ERG9	YHR190W	1335 nt		3.58	□□□□□ -1.84
DSL1	P53847	ART10	YLR392C	1557 nt		3.58	□□□□□ -1.84
DSL1	P53847	ISW2	YOR304W	3363 nt		3.58	□□□□□ -1.84
DSL1	P53847	SSE2	YBR169C	2082 nt		3.58	□□□□□ -1.84
DSL1	P53847	MDN1	YLR106C	14733 nt		3.57	□□□□□ -1.84
DSL1	P53847	SMC3	YJL074C	3693 nt		3.57	□□□□□ -1.84
DSL1	P53847	UBP12	YJL197W	3765 nt		3.57	□□□□□ -1.84
DSL1	P53847	TRX3	YCR083W	384 nt		3.57	□□□□□ -1.84

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