Protein–RNA interactions for Protein: P52888

THOP1, Thimet oligopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THOP1P52888 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
THOP1P52888 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
THOP1P52888 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
THOP1P52888 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
THOP1P52888 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
THOP1P52888 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
THOP1P52888 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
THOP1P52888 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
THOP1P52888 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
THOP1P52888 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
THOP1P52888 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
THOP1P52888 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
THOP1P52888 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
THOP1P52888 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
THOP1P52888 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
THOP1P52888 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
THOP1P52888 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
THOP1P52888 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
THOP1P52888 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
THOP1P52888 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
THOP1P52888 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
THOP1P52888 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
THOP1P52888 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
THOP1P52888 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
THOP1P52888 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
THOP1P52888 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
THOP1P52888 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
THOP1P52888 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
THOP1P52888 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
THOP1P52888 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
THOP1P52888 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
THOP1P52888 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
THOP1P52888 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
THOP1P52888 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
THOP1P52888 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
THOP1P52888 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
THOP1P52888 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
THOP1P52888 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
THOP1P52888 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
THOP1P52888 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
THOP1P52888 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
THOP1P52888 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
THOP1P52888 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
THOP1P52888 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
THOP1P52888 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
THOP1P52888 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
THOP1P52888 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
THOP1P52888 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
THOP1P52888 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
THOP1P52888 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
THOP1P52888 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
THOP1P52888 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
THOP1P52888 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
THOP1P52888 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
THOP1P52888 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
THOP1P52888 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
THOP1P52888 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
THOP1P52888 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
THOP1P52888 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
THOP1P52888 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
THOP1P52888 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
THOP1P52888 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
THOP1P52888 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
THOP1P52888 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
THOP1P52888 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
THOP1P52888 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
THOP1P52888 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
THOP1P52888 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
THOP1P52888 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
THOP1P52888 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
THOP1P52888 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
THOP1P52888 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
THOP1P52888 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
THOP1P52888 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
THOP1P52888 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
THOP1P52888 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
THOP1P52888 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
THOP1P52888 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
THOP1P52888 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
THOP1P52888 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
THOP1P52888 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
THOP1P52888 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
THOP1P52888 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
THOP1P52888 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
THOP1P52888 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
THOP1P52888 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
THOP1P52888 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
THOP1P52888 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
THOP1P52888 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
THOP1P52888 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
THOP1P52888 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
THOP1P52888 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
THOP1P52888 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
THOP1P52888 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
THOP1P52888 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
THOP1P52888 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
THOP1P52888 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
THOP1P52888 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
THOP1P52888 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
THOP1P52888 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms