Protein–RNA interactions for Protein: P52790

HK3, Hexokinase-3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HK3P52790 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HK3P52790 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HK3P52790 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HK3P52790 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HK3P52790 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HK3P52790 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HK3P52790 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HK3P52790 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HK3P52790 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HK3P52790 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HK3P52790 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HK3P52790 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HK3P52790 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HK3P52790 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HK3P52790 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HK3P52790 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HK3P52790 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HK3P52790 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HK3P52790 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HK3P52790 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HK3P52790 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HK3P52790 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HK3P52790 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HK3P52790 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HK3P52790 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HK3P52790 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HK3P52790 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HK3P52790 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HK3P52790 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HK3P52790 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HK3P52790 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HK3P52790 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HK3P52790 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HK3P52790 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HK3P52790 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HK3P52790 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HK3P52790 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HK3P52790 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HK3P52790 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HK3P52790 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HK3P52790 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HK3P52790 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HK3P52790 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HK3P52790 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HK3P52790 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HK3P52790 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HK3P52790 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HK3P52790 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HK3P52790 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HK3P52790 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HK3P52790 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HK3P52790 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HK3P52790 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HK3P52790 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HK3P52790 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HK3P52790 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HK3P52790 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HK3P52790 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HK3P52790 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HK3P52790 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HK3P52790 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HK3P52790 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HK3P52790 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HK3P52790 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HK3P52790 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HK3P52790 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HK3P52790 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HK3P52790 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HK3P52790 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HK3P52790 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HK3P52790 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HK3P52790 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HK3P52790 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HK3P52790 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HK3P52790 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HK3P52790 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HK3P52790 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HK3P52790 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HK3P52790 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HK3P52790 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HK3P52790 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HK3P52790 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HK3P52790 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HK3P52790 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HK3P52790 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HK3P52790 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HK3P52790 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HK3P52790 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HK3P52790 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HK3P52790 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HK3P52790 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HK3P52790 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HK3P52790 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HK3P52790 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HK3P52790 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HK3P52790 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HK3P52790 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HK3P52790 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HK3P52790 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HK3P52790 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms