Protein–RNA interactions for Protein: P51003

PAPOLA, Poly(A) polymerase alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLAP51003 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAPOLAP51003 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAPOLAP51003 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAPOLAP51003 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAPOLAP51003 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAPOLAP51003 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAPOLAP51003 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAPOLAP51003 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAPOLAP51003 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAPOLAP51003 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAPOLAP51003 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAPOLAP51003 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAPOLAP51003 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAPOLAP51003 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAPOLAP51003 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAPOLAP51003 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAPOLAP51003 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAPOLAP51003 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAPOLAP51003 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAPOLAP51003 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAPOLAP51003 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAPOLAP51003 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAPOLAP51003 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAPOLAP51003 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PAPOLAP51003 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PAPOLAP51003 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAPOLAP51003 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAPOLAP51003 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAPOLAP51003 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PAPOLAP51003 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAPOLAP51003 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAPOLAP51003 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAPOLAP51003 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAPOLAP51003 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAPOLAP51003 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAPOLAP51003 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAPOLAP51003 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAPOLAP51003 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAPOLAP51003 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAPOLAP51003 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAPOLAP51003 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAPOLAP51003 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAPOLAP51003 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PAPOLAP51003 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAPOLAP51003 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAPOLAP51003 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAPOLAP51003 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAPOLAP51003 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAPOLAP51003 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAPOLAP51003 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAPOLAP51003 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAPOLAP51003 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAPOLAP51003 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAPOLAP51003 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PAPOLAP51003 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAPOLAP51003 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAPOLAP51003 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PAPOLAP51003 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAPOLAP51003 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAPOLAP51003 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAPOLAP51003 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAPOLAP51003 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAPOLAP51003 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAPOLAP51003 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PAPOLAP51003 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PAPOLAP51003 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PAPOLAP51003 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PAPOLAP51003 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAPOLAP51003 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAPOLAP51003 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAPOLAP51003 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAPOLAP51003 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAPOLAP51003 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAPOLAP51003 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PAPOLAP51003 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAPOLAP51003 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAPOLAP51003 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAPOLAP51003 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAPOLAP51003 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAPOLAP51003 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAPOLAP51003 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAPOLAP51003 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAPOLAP51003 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAPOLAP51003 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAPOLAP51003 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAPOLAP51003 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAPOLAP51003 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAPOLAP51003 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAPOLAP51003 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAPOLAP51003 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAPOLAP51003 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAPOLAP51003 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAPOLAP51003 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAPOLAP51003 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PAPOLAP51003 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAPOLAP51003 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAPOLAP51003 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAPOLAP51003 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAPOLAP51003 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAPOLAP51003 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.6 ms