Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASP4P49662 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASP4P49662 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASP4P49662 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASP4P49662 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASP4P49662 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASP4P49662 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASP4P49662 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASP4P49662 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASP4P49662 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASP4P49662 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASP4P49662 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CASP4P49662 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASP4P49662 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASP4P49662 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASP4P49662 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CASP4P49662 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASP4P49662 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASP4P49662 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASP4P49662 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASP4P49662 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASP4P49662 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASP4P49662 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASP4P49662 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASP4P49662 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CASP4P49662 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CASP4P49662 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CASP4P49662 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CASP4P49662 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CASP4P49662 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CASP4P49662 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CASP4P49662 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CASP4P49662 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CASP4P49662 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CASP4P49662 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CASP4P49662 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CASP4P49662 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASP4P49662 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASP4P49662 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASP4P49662 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASP4P49662 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASP4P49662 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASP4P49662 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASP4P49662 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASP4P49662 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASP4P49662 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASP4P49662 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASP4P49662 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASP4P49662 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASP4P49662 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASP4P49662 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASP4P49662 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASP4P49662 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASP4P49662 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASP4P49662 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASP4P49662 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASP4P49662 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASP4P49662 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASP4P49662 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASP4P49662 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASP4P49662 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASP4P49662 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASP4P49662 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASP4P49662 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASP4P49662 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASP4P49662 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASP4P49662 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASP4P49662 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASP4P49662 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASP4P49662 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CASP4P49662 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASP4P49662 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASP4P49662 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASP4P49662 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASP4P49662 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CASP4P49662 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASP4P49662 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASP4P49662 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASP4P49662 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP4P49662 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP4P49662 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP4P49662 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP4P49662 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP4P49662 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP4P49662 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP4P49662 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP4P49662 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP4P49662 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP4P49662 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP4P49662 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP4P49662 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP4P49662 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASP4P49662 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASP4P49662 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASP4P49662 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASP4P49662 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASP4P49662 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CASP4P49662 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASP4P49662 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASP4P49662 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms