Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TGM4P49221 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TGM4P49221 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TGM4P49221 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TGM4P49221 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TGM4P49221 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TGM4P49221 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TGM4P49221 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TGM4P49221 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TGM4P49221 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TGM4P49221 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TGM4P49221 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TGM4P49221 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TGM4P49221 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TGM4P49221 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TGM4P49221 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TGM4P49221 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TGM4P49221 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TGM4P49221 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TGM4P49221 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TGM4P49221 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TGM4P49221 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TGM4P49221 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TGM4P49221 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TGM4P49221 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TGM4P49221 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TGM4P49221 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TGM4P49221 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TGM4P49221 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TGM4P49221 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TGM4P49221 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TGM4P49221 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TGM4P49221 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TGM4P49221 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TGM4P49221 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TGM4P49221 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TGM4P49221 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TGM4P49221 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TGM4P49221 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TGM4P49221 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TGM4P49221 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TGM4P49221 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TGM4P49221 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TGM4P49221 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TGM4P49221 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TGM4P49221 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TGM4P49221 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TGM4P49221 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TGM4P49221 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TGM4P49221 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TGM4P49221 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TGM4P49221 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TGM4P49221 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TGM4P49221 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TGM4P49221 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TGM4P49221 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TGM4P49221 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TGM4P49221 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TGM4P49221 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TGM4P49221 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TGM4P49221 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TGM4P49221 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TGM4P49221 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TGM4P49221 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TGM4P49221 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TGM4P49221 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TGM4P49221 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TGM4P49221 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TGM4P49221 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TGM4P49221 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TGM4P49221 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TGM4P49221 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TGM4P49221 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TGM4P49221 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TGM4P49221 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TGM4P49221 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TGM4P49221 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TGM4P49221 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TGM4P49221 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TGM4P49221 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TGM4P49221 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TGM4P49221 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TGM4P49221 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TGM4P49221 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TGM4P49221 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TGM4P49221 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TGM4P49221 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TGM4P49221 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TGM4P49221 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TGM4P49221 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TGM4P49221 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TGM4P49221 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TGM4P49221 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TGM4P49221 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TGM4P49221 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TGM4P49221 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TGM4P49221 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TGM4P49221 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TGM4P49221 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TGM4P49221 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms