Protein–RNA interactions for Protein: P48553

TRAPPC10, Trafficking protein particle complex subunit 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10P48553 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAPPC10P48553 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAPPC10P48553 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAPPC10P48553 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAPPC10P48553 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAPPC10P48553 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAPPC10P48553 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAPPC10P48553 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAPPC10P48553 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAPPC10P48553 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAPPC10P48553 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAPPC10P48553 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAPPC10P48553 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAPPC10P48553 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAPPC10P48553 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAPPC10P48553 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAPPC10P48553 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAPPC10P48553 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAPPC10P48553 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAPPC10P48553 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAPPC10P48553 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAPPC10P48553 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAPPC10P48553 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAPPC10P48553 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAPPC10P48553 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAPPC10P48553 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAPPC10P48553 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAPPC10P48553 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAPPC10P48553 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAPPC10P48553 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAPPC10P48553 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC10P48553 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC10P48553 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC10P48553 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC10P48553 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC10P48553 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC10P48553 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC10P48553 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC10P48553 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC10P48553 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC10P48553 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC10P48553 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAPPC10P48553 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAPPC10P48553 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAPPC10P48553 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAPPC10P48553 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAPPC10P48553 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAPPC10P48553 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAPPC10P48553 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAPPC10P48553 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAPPC10P48553 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAPPC10P48553 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAPPC10P48553 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAPPC10P48553 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAPPC10P48553 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAPPC10P48553 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAPPC10P48553 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAPPC10P48553 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAPPC10P48553 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRAPPC10P48553 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRAPPC10P48553 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
TRAPPC10P48553 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRAPPC10P48553 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
TRAPPC10P48553 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRAPPC10P48553 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRAPPC10P48553 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRAPPC10P48553 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRAPPC10P48553 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TRAPPC10P48553 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRAPPC10P48553 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRAPPC10P48553 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRAPPC10P48553 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRAPPC10P48553 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAPPC10P48553 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAPPC10P48553 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAPPC10P48553 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAPPC10P48553 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAPPC10P48553 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAPPC10P48553 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAPPC10P48553 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAPPC10P48553 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAPPC10P48553 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAPPC10P48553 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAPPC10P48553 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAPPC10P48553 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC10P48553 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC10P48553 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC10P48553 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC10P48553 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC10P48553 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC10P48553 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC10P48553 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC10P48553 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC10P48553 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC10P48553 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC10P48553 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC10P48553 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC10P48553 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC10P48553 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC10P48553 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms