Protein–RNA interactions for Protein: P41219

PRPH, Peripherin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPHP41219 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPHP41219 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPHP41219 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPHP41219 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPHP41219 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPHP41219 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPHP41219 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPHP41219 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPHP41219 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPHP41219 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPHP41219 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPHP41219 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPHP41219 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPHP41219 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPHP41219 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPHP41219 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPHP41219 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPHP41219 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPHP41219 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPHP41219 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPHP41219 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPHP41219 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPHP41219 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPHP41219 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPHP41219 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPHP41219 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPHP41219 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPHP41219 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPHP41219 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPHP41219 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPHP41219 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPHP41219 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPHP41219 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPHP41219 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPHP41219 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPHP41219 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPHP41219 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPHP41219 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPHP41219 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPHP41219 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPHP41219 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPHP41219 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPHP41219 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPHP41219 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPHP41219 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPHP41219 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPHP41219 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPHP41219 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPHP41219 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPHP41219 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPHP41219 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPHP41219 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPHP41219 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPHP41219 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPHP41219 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPHP41219 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPHP41219 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPHP41219 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPHP41219 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPHP41219 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPHP41219 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPHP41219 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPHP41219 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPHP41219 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPHP41219 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPHP41219 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPHP41219 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPHP41219 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPHP41219 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPHP41219 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPHP41219 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPHP41219 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPHP41219 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPHP41219 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPHP41219 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPHP41219 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPHP41219 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPHP41219 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPHP41219 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPHP41219 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPHP41219 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPHP41219 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPHP41219 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPHP41219 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPHP41219 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPHP41219 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPHP41219 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPHP41219 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPHP41219 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPHP41219 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPHP41219 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPHP41219 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPHP41219 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPHP41219 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPHP41219 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPHP41219 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPHP41219 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPHP41219 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPHP41219 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPHP41219 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms