Protein–RNA interactions for Protein: P40087

DDI1, DNA damage-inducible protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1P40087 RPC34YNR003C 954 nt3.1□□□□□ -1.91
DDI1P40087 PNT1YOR266W 1272 nt3.1□□□□□ -1.91
DDI1P40087 PST1YDR055W 1335 nt3.1□□□□□ -1.91
DDI1P40087 ARP4YJL081C 1470 nt3.09□□□□□ -1.91
DDI1P40087 SEC59YMR013C 1560 nt3.09□□□□□ -1.91
DDI1P40087 YPL109CYPL109C 1974 nt3.09□□□□□ -1.91
DDI1P40087 CPR1YDR155C 489 nt3.09□□□□□ -1.91
DDI1P40087 RPL30YGL030W 318 nt3.09□□□□□ -1.91
DDI1P40087 CIR1YGR207C 786 nt3.09□□□□□ -1.91
DDI1P40087 MRPL49YJL096W 486 nt3.09□□□□□ -1.91
DDI1P40087 YLR444CYLR444C 303 nt3.09□□□□□ -1.91
DDI1P40087 SUP45YBR143C 1314 nt3.09□□□□□ -1.91
DDI1P40087 TAO3YIL129C 7131 nt3.09□□□□□ -1.91
DDI1P40087 RPA135YPR010C 3612 nt3.08□□□□□ -1.92
DDI1P40087 LIF1YGL090W 1266 nt3.08□□□□□ -1.92
DDI1P40087 MSA2YKR077W 1092 nt3.08□□□□□ -1.92
DDI1P40087 HRT3YLR097C 1035 nt3.08□□□□□ -1.92
DDI1P40087 IMP1YMR150C 573 nt3.08□□□□□ -1.92
DDI1P40087 HRT1YOL133W 366 nt3.08□□□□□ -1.92
DDI1P40087 YPR136CYPR136C 513 nt3.08□□□□□ -1.92
DDI1P40087 BCS1YDR375C 1371 nt3.08□□□□□ -1.92
DDI1P40087 ACA1YER045C 1470 nt3.08□□□□□ -1.92
DDI1P40087 FLO5YHR211W 3228 nt3.08□□□□□ -1.92
DDI1P40087 SKN7YHR206W 1869 nt3.07□□□□□ -1.92
DDI1P40087 VTC4YJL012C 2166 nt3.07□□□□□ -1.92
DDI1P40087 CWC2YDL209C 1020 nt3.07□□□□□ -1.92
DDI1P40087 MSW1YDR268W 1140 nt3.07□□□□□ -1.92
DDI1P40087 BSC2YDR275W 708 nt3.07□□□□□ -1.92
DDI1P40087 DYN2YDR424C 279 nt3.07□□□□□ -1.92
DDI1P40087 IES6YEL044W 501 nt3.07□□□□□ -1.92
DDI1P40087 KXD1YGL079W 657 nt3.07□□□□□ -1.92
DDI1P40087 AML1YGR001C 747 nt3.07□□□□□ -1.92
DDI1P40087 MRPS35YGR165W 1038 nt3.07□□□□□ -1.92
DDI1P40087 REX3YLR107W 1215 nt3.07□□□□□ -1.92
DDI1P40087 MRPS17YMR188C 714 nt3.07□□□□□ -1.92
DDI1P40087 YBL081WYBL081W 1107 nt3.07□□□□□ -1.92
DDI1P40087 CCM1YGR150C 2595 nt3.07□□□□□ -1.92
DDI1P40087 YDR089WYDR089W 2610 nt3.07□□□□□ -1.92
DDI1P40087 LTV1YKL143W 1392 nt3.07□□□□□ -1.92
DDI1P40087 XRN1YGL173C 4587 nt3.07□□□□□ -1.92
DDI1P40087 AEP3YPL005W 1821 nt3.07□□□□□ -1.92
DDI1P40087 MED2YDL005C 1296 nt3.06□□□□□ -1.92
DDI1P40087 YDL162CYDL162C 357 nt3.06□□□□□ -1.92
DDI1P40087 LST7YGR057C 729 nt3.06□□□□□ -1.92
DDI1P40087 YPT35YHR105W 645 nt3.06□□□□□ -1.92
DDI1P40087 RPC17YJL011C 486 nt3.06□□□□□ -1.92
DDI1P40087 PHD1YKL043W 1101 nt3.06□□□□□ -1.92
DDI1P40087 YKL091CYKL091C 933 nt3.06□□□□□ -1.92
DDI1P40087 YNL320WYNL320W 855 nt3.06□□□□□ -1.92
DDI1P40087 PLP2YOR281C 861 nt3.06□□□□□ -1.92
DDI1P40087 CHS2YBR038W 2892 nt3.06□□□□□ -1.92
DDI1P40087 REC8YPR007C 2043 nt3.06□□□□□ -1.92
DDI1P40087 DNM1YLL001W 2274 nt3.05□□□□□ -1.92
DDI1P40087 ACK1YDL203C 1872 nt3.05□□□□□ -1.92
DDI1P40087 CTM1YHR109W 1758 nt3.05□□□□□ -1.92
DDI1P40087 ALG8YOR067C 1734 nt3.05□□□□□ -1.92
DDI1P40087 SET1YHR119W 3243 nt3.05□□□□□ -1.92
DDI1P40087 ARO1YDR127W 4767 nt3.05□□□□□ -1.92
DDI1P40087 TGL2YDR058C 981 nt3.05□□□□□ -1.92
DDI1P40087 RRP17YDR412W 708 nt3.05□□□□□ -1.92
DDI1P40087 EDC1YGL222C 528 nt3.05□□□□□ -1.92
DDI1P40087 SCM4YGR049W 564 nt3.05□□□□□ -1.92
DDI1P40087 RSF1YMR030W 1131 nt3.05□□□□□ -1.92
DDI1P40087 RLP7YNL002C 969 nt3.05□□□□□ -1.92
DDI1P40087 HUB1YNR032C-A 222 nt3.05□□□□□ -1.92
DDI1P40087 RIB4YOL143C 510 nt3.05□□□□□ -1.92
DDI1P40087 DGA1YOR245C 1257 nt3.05□□□□□ -1.92
DDI1P40087 YDL176WYDL176W 2127 nt3.05□□□□□ -1.92
DDI1P40087 AEP2YMR282C 1743 nt3.05□□□□□ -1.92
DDI1P40087 CLB3YDL155W 1284 nt3.04□□□□□ -1.92
DDI1P40087 OTU1YFL044C 906 nt3.04□□□□□ -1.92
DDI1P40087 RPS0AYGR214W 759 nt3.04□□□□□ -1.92
DDI1P40087 YIR014WYIR014W 729 nt3.04□□□□□ -1.92
DDI1P40087 PBA1YLR199C 831 nt3.04□□□□□ -1.92
DDI1P40087 YAR075WYAR075W 474 nt3.04□□□□□ -1.92
DDI1P40087 BUD21YOR078W 645 nt3.04□□□□□ -1.92
DDI1P40087 YOR263CYOR263C 408 nt3.04□□□□□ -1.92
DDI1P40087 YPL071CYPL071C 471 nt3.04□□□□□ -1.92
DDI1P40087 OXR1YPL196W 822 nt3.04□□□□□ -1.92
DDI1P40087 UBP5YER144C 2418 nt3.04□□□□□ -1.92
DDI1P40087 CDH1YGL003C 1701 nt3.04□□□□□ -1.92
DDI1P40087 TFB2YPL122C 1542 nt3.03□□□□□ -1.92
DDI1P40087 ARG2YJL071W 1725 nt3.03□□□□□ -1.92
DDI1P40087 YCR085WYCR085W 354 nt3.03□□□□□ -1.92
DDI1P40087 PCL2YDL127W 927 nt3.03□□□□□ -1.92
DDI1P40087 CTH1YDR151C 978 nt3.03□□□□□ -1.92
DDI1P40087 YFL051CYFL051C 483 nt3.03□□□□□ -1.92
DDI1P40087 TAM41YGR046W 1158 nt3.03□□□□□ -1.92
DDI1P40087 PCD1YLR151C 1023 nt3.03□□□□□ -1.92
DDI1P40087 RPN13YLR421C 471 nt3.03□□□□□ -1.92
DDI1P40087 PFK27YOL136C 1194 nt3.03□□□□□ -1.92
DDI1P40087 CYC2YOR037W 1101 nt3.03□□□□□ -1.92
DDI1P40087 VAM10YOR068C 345 nt3.03□□□□□ -1.92
DDI1P40087 CAF20YOR276W 486 nt3.03□□□□□ -1.92
DDI1P40087 YBR300CYBR300C 498 nt3.03□□□□□ -1.92
DDI1P40087 SIN4YNL236W 2925 nt3.03□□□□□ -1.92
DDI1P40087 DBP5YOR046C 1449 nt3.02□□□□□ -1.93
DDI1P40087 MIX14YDR031W 366 nt3.02□□□□□ -1.93
DDI1P40087 FOL2YGR267C 732 nt3.02□□□□□ -1.93
DDI1P40087 GMH1YKR030W 822 nt3.02□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.3 ms