Protein–RNA interactions for Protein: P38398

BRCA1, Breast cancer type 1 susceptibility protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA1P38398 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
BRCA1P38398 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
BRCA1P38398 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
BRCA1P38398 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
BRCA1P38398 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
BRCA1P38398 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
BRCA1P38398 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
BRCA1P38398 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
BRCA1P38398 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BRCA1P38398 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BRCA1P38398 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BRCA1P38398 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BRCA1P38398 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
BRCA1P38398 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BRCA1P38398 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
BRCA1P38398 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
BRCA1P38398 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
BRCA1P38398 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
BRCA1P38398 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
BRCA1P38398 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
BRCA1P38398 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BRCA1P38398 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BRCA1P38398 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BRCA1P38398 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BRCA1P38398 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BRCA1P38398 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BRCA1P38398 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BRCA1P38398 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BRCA1P38398 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BRCA1P38398 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BRCA1P38398 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BRCA1P38398 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
BRCA1P38398 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BRCA1P38398 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BRCA1P38398 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BRCA1P38398 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BRCA1P38398 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BRCA1P38398 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BRCA1P38398 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRCA1P38398 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRCA1P38398 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRCA1P38398 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRCA1P38398 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRCA1P38398 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRCA1P38398 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRCA1P38398 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
BRCA1P38398 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRCA1P38398 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRCA1P38398 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRCA1P38398 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRCA1P38398 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRCA1P38398 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRCA1P38398 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRCA1P38398 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BRCA1P38398 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BRCA1P38398 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BRCA1P38398 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BRCA1P38398 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BRCA1P38398 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BRCA1P38398 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BRCA1P38398 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BRCA1P38398 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BRCA1P38398 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
BRCA1P38398 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BRCA1P38398 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BRCA1P38398 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BRCA1P38398 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BRCA1P38398 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BRCA1P38398 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BRCA1P38398 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BRCA1P38398 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BRCA1P38398 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BRCA1P38398 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BRCA1P38398 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BRCA1P38398 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BRCA1P38398 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BRCA1P38398 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BRCA1P38398 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BRCA1P38398 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BRCA1P38398 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BRCA1P38398 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
BRCA1P38398 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BRCA1P38398 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
BRCA1P38398 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
BRCA1P38398 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
BRCA1P38398 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BRCA1P38398 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BRCA1P38398 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BRCA1P38398 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BRCA1P38398 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
BRCA1P38398 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BRCA1P38398 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BRCA1P38398 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BRCA1P38398 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BRCA1P38398 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BRCA1P38398 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
BRCA1P38398 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
BRCA1P38398 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
BRCA1P38398 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
BRCA1P38398 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms