Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPARGP37231 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPARGP37231 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPARGP37231 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPARGP37231 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPARGP37231 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPARGP37231 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPARGP37231 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPARGP37231 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPARGP37231 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPARGP37231 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPARGP37231 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPARGP37231 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPARGP37231 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPARGP37231 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPARGP37231 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPARGP37231 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPARGP37231 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPARGP37231 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPARGP37231 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPARGP37231 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPARGP37231 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPARGP37231 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PPARGP37231 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPARGP37231 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPARGP37231 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPARGP37231 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPARGP37231 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPARGP37231 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPARGP37231 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPARGP37231 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPARGP37231 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPARGP37231 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPARGP37231 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PPARGP37231 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPARGP37231 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPARGP37231 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPARGP37231 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPARGP37231 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPARGP37231 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPARGP37231 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPARGP37231 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPARGP37231 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPARGP37231 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPARGP37231 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPARGP37231 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPARGP37231 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPARGP37231 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PPARGP37231 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPARGP37231 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPARGP37231 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPARGP37231 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPARGP37231 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPARGP37231 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPARGP37231 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPARGP37231 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPARGP37231 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPARGP37231 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPARGP37231 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPARGP37231 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPARGP37231 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPARGP37231 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPARGP37231 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPARGP37231 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPARGP37231 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPARGP37231 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PPARGP37231 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPARGP37231 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PPARGP37231 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PPARGP37231 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPARGP37231 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPARGP37231 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPARGP37231 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPARGP37231 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPARGP37231 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPARGP37231 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPARGP37231 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPARGP37231 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPARGP37231 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPARGP37231 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PPARGP37231 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PPARGP37231 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPARGP37231 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPARGP37231 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPARGP37231 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPARGP37231 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPARGP37231 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPARGP37231 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PPARGP37231 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPARGP37231 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPARGP37231 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPARGP37231 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPARGP37231 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPARGP37231 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPARGP37231 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPARGP37231 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPARGP37231 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPARGP37231 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPARGP37231 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPARGP37231 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms