Protein–RNA interactions for Protein: P35251

RFC1, Replication factor C subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC1P35251 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFC1P35251 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFC1P35251 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFC1P35251 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RFC1P35251 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RFC1P35251 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFC1P35251 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFC1P35251 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFC1P35251 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFC1P35251 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFC1P35251 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFC1P35251 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFC1P35251 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFC1P35251 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFC1P35251 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFC1P35251 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFC1P35251 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFC1P35251 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFC1P35251 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFC1P35251 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFC1P35251 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RFC1P35251 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RFC1P35251 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFC1P35251 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFC1P35251 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFC1P35251 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFC1P35251 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFC1P35251 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFC1P35251 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFC1P35251 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFC1P35251 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RFC1P35251 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFC1P35251 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFC1P35251 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFC1P35251 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFC1P35251 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFC1P35251 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFC1P35251 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFC1P35251 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RFC1P35251 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFC1P35251 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFC1P35251 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFC1P35251 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFC1P35251 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFC1P35251 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFC1P35251 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFC1P35251 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFC1P35251 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFC1P35251 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFC1P35251 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFC1P35251 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RFC1P35251 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFC1P35251 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFC1P35251 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFC1P35251 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFC1P35251 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFC1P35251 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFC1P35251 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFC1P35251 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFC1P35251 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RFC1P35251 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFC1P35251 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFC1P35251 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFC1P35251 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFC1P35251 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFC1P35251 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFC1P35251 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFC1P35251 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFC1P35251 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFC1P35251 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFC1P35251 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFC1P35251 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFC1P35251 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFC1P35251 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RFC1P35251 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFC1P35251 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFC1P35251 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFC1P35251 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RFC1P35251 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFC1P35251 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFC1P35251 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFC1P35251 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFC1P35251 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFC1P35251 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFC1P35251 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFC1P35251 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RFC1P35251 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RFC1P35251 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RFC1P35251 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RFC1P35251 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RFC1P35251 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RFC1P35251 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RFC1P35251 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RFC1P35251 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RFC1P35251 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RFC1P35251 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RFC1P35251 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RFC1P35251 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RFC1P35251 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RFC1P35251 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms