Protein–RNA interactions for Protein: P30038

ALDH4A1, Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH4A1P30038 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ALDH4A1P30038 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ALDH4A1P30038 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ALDH4A1P30038 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ALDH4A1P30038 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ALDH4A1P30038 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ALDH4A1P30038 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALDH4A1P30038 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALDH4A1P30038 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALDH4A1P30038 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALDH4A1P30038 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALDH4A1P30038 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALDH4A1P30038 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALDH4A1P30038 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALDH4A1P30038 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALDH4A1P30038 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALDH4A1P30038 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALDH4A1P30038 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ALDH4A1P30038 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ALDH4A1P30038 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ALDH4A1P30038 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ALDH4A1P30038 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ALDH4A1P30038 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ALDH4A1P30038 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ALDH4A1P30038 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ALDH4A1P30038 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ALDH4A1P30038 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ALDH4A1P30038 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ALDH4A1P30038 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ALDH4A1P30038 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ALDH4A1P30038 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ALDH4A1P30038 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ALDH4A1P30038 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ALDH4A1P30038 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ALDH4A1P30038 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ALDH4A1P30038 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ALDH4A1P30038 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ALDH4A1P30038 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ALDH4A1P30038 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ALDH4A1P30038 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ALDH4A1P30038 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ALDH4A1P30038 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ALDH4A1P30038 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ALDH4A1P30038 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ALDH4A1P30038 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ALDH4A1P30038 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ALDH4A1P30038 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ALDH4A1P30038 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ALDH4A1P30038 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ALDH4A1P30038 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ALDH4A1P30038 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ALDH4A1P30038 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ALDH4A1P30038 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ALDH4A1P30038 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ALDH4A1P30038 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ALDH4A1P30038 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ALDH4A1P30038 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ALDH4A1P30038 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ALDH4A1P30038 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ALDH4A1P30038 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALDH4A1P30038 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALDH4A1P30038 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALDH4A1P30038 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ALDH4A1P30038 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALDH4A1P30038 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALDH4A1P30038 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALDH4A1P30038 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALDH4A1P30038 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALDH4A1P30038 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALDH4A1P30038 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALDH4A1P30038 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALDH4A1P30038 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALDH4A1P30038 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALDH4A1P30038 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALDH4A1P30038 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALDH4A1P30038 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALDH4A1P30038 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALDH4A1P30038 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALDH4A1P30038 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALDH4A1P30038 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALDH4A1P30038 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ALDH4A1P30038 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ALDH4A1P30038 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ALDH4A1P30038 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ALDH4A1P30038 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ALDH4A1P30038 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ALDH4A1P30038 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ALDH4A1P30038 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ALDH4A1P30038 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ALDH4A1P30038 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ALDH4A1P30038 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ALDH4A1P30038 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ALDH4A1P30038 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ALDH4A1P30038 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms