Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJB2P29033 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJB2P29033 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJB2P29033 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJB2P29033 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJB2P29033 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJB2P29033 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJB2P29033 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJB2P29033 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJB2P29033 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJB2P29033 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJB2P29033 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJB2P29033 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJB2P29033 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJB2P29033 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJB2P29033 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJB2P29033 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
GJB2P29033 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJB2P29033 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJB2P29033 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJB2P29033 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJB2P29033 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJB2P29033 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJB2P29033 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJB2P29033 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJB2P29033 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJB2P29033 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJB2P29033 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJB2P29033 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJB2P29033 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJB2P29033 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJB2P29033 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJB2P29033 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJB2P29033 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJB2P29033 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJB2P29033 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJB2P29033 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJB2P29033 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJB2P29033 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJB2P29033 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJB2P29033 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GJB2P29033 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJB2P29033 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJB2P29033 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GJB2P29033 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJB2P29033 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJB2P29033 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJB2P29033 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJB2P29033 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJB2P29033 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJB2P29033 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJB2P29033 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJB2P29033 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJB2P29033 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJB2P29033 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJB2P29033 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GJB2P29033 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJB2P29033 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJB2P29033 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJB2P29033 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJB2P29033 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJB2P29033 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJB2P29033 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJB2P29033 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJB2P29033 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJB2P29033 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJB2P29033 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJB2P29033 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJB2P29033 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJB2P29033 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJB2P29033 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJB2P29033 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
GJB2P29033 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJB2P29033 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJB2P29033 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJB2P29033 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJB2P29033 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJB2P29033 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJB2P29033 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJB2P29033 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GJB2P29033 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GJB2P29033 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJB2P29033 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJB2P29033 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJB2P29033 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GJB2P29033 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GJB2P29033 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GJB2P29033 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GJB2P29033 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GJB2P29033 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GJB2P29033 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GJB2P29033 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GJB2P29033 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GJB2P29033 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GJB2P29033 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GJB2P29033 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GJB2P29033 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GJB2P29033 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GJB2P29033 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GJB2P29033 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms