Protein–RNA interactions for Protein: P23921

RRM1, Ribonucleoside-diphosphate reductase large subunit, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRM1P23921 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRM1P23921 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRM1P23921 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRM1P23921 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRM1P23921 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RRM1P23921 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RRM1P23921 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRM1P23921 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRM1P23921 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRM1P23921 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRM1P23921 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRM1P23921 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRM1P23921 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRM1P23921 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RRM1P23921 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RRM1P23921 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RRM1P23921 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RRM1P23921 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RRM1P23921 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRM1P23921 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRM1P23921 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRM1P23921 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRM1P23921 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRM1P23921 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRM1P23921 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRM1P23921 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRM1P23921 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RRM1P23921 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRM1P23921 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRM1P23921 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRM1P23921 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRM1P23921 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRM1P23921 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRM1P23921 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRM1P23921 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRM1P23921 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRM1P23921 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRM1P23921 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRM1P23921 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRM1P23921 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRM1P23921 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRM1P23921 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRM1P23921 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRM1P23921 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRM1P23921 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RRM1P23921 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRM1P23921 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRM1P23921 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRM1P23921 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRM1P23921 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRM1P23921 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRM1P23921 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRM1P23921 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRM1P23921 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRM1P23921 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RRM1P23921 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRM1P23921 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRM1P23921 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RRM1P23921 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRM1P23921 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRM1P23921 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RRM1P23921 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRM1P23921 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRM1P23921 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRM1P23921 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRM1P23921 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRM1P23921 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RRM1P23921 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRM1P23921 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRM1P23921 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRM1P23921 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRM1P23921 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRM1P23921 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRM1P23921 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRM1P23921 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRM1P23921 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRM1P23921 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRM1P23921 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RRM1P23921 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRM1P23921 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RRM1P23921 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRM1P23921 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRM1P23921 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRM1P23921 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRM1P23921 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRM1P23921 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RRM1P23921 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RRM1P23921 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RRM1P23921 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RRM1P23921 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RRM1P23921 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RRM1P23921 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RRM1P23921 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RRM1P23921 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RRM1P23921 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RRM1P23921 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RRM1P23921 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RRM1P23921 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RRM1P23921 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RRM1P23921 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms