Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPI1P17947 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPI1P17947 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPI1P17947 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPI1P17947 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPI1P17947 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPI1P17947 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPI1P17947 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPI1P17947 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPI1P17947 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPI1P17947 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPI1P17947 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SPI1P17947 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SPI1P17947 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SPI1P17947 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SPI1P17947 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPI1P17947 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPI1P17947 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPI1P17947 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPI1P17947 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPI1P17947 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SPI1P17947 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPI1P17947 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPI1P17947 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPI1P17947 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPI1P17947 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPI1P17947 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPI1P17947 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPI1P17947 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPI1P17947 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPI1P17947 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SPI1P17947 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPI1P17947 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPI1P17947 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPI1P17947 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPI1P17947 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPI1P17947 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPI1P17947 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPI1P17947 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPI1P17947 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPI1P17947 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPI1P17947 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPI1P17947 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPI1P17947 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPI1P17947 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPI1P17947 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPI1P17947 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPI1P17947 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPI1P17947 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPI1P17947 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPI1P17947 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPI1P17947 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPI1P17947 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPI1P17947 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SPI1P17947 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SPI1P17947 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPI1P17947 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPI1P17947 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPI1P17947 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPI1P17947 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SPI1P17947 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPI1P17947 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPI1P17947 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPI1P17947 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPI1P17947 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPI1P17947 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPI1P17947 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPI1P17947 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPI1P17947 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPI1P17947 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPI1P17947 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SPI1P17947 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPI1P17947 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPI1P17947 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPI1P17947 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPI1P17947 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPI1P17947 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPI1P17947 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPI1P17947 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPI1P17947 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPI1P17947 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPI1P17947 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPI1P17947 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPI1P17947 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPI1P17947 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPI1P17947 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPI1P17947 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SPI1P17947 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPI1P17947 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPI1P17947 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPI1P17947 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPI1P17947 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPI1P17947 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPI1P17947 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPI1P17947 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SPI1P17947 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPI1P17947 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPI1P17947 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPI1P17947 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPI1P17947 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms