Protein–RNA interactions for Protein: P15976

GATA1, Erythroid transcription factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA1P15976 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATA1P15976 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATA1P15976 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATA1P15976 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATA1P15976 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATA1P15976 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATA1P15976 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATA1P15976 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATA1P15976 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATA1P15976 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GATA1P15976 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GATA1P15976 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GATA1P15976 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GATA1P15976 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GATA1P15976 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GATA1P15976 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GATA1P15976 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GATA1P15976 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GATA1P15976 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GATA1P15976 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GATA1P15976 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GATA1P15976 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GATA1P15976 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GATA1P15976 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GATA1P15976 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GATA1P15976 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GATA1P15976 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GATA1P15976 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATA1P15976 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATA1P15976 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATA1P15976 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATA1P15976 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATA1P15976 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATA1P15976 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATA1P15976 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATA1P15976 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATA1P15976 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATA1P15976 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATA1P15976 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATA1P15976 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATA1P15976 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATA1P15976 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATA1P15976 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATA1P15976 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATA1P15976 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATA1P15976 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATA1P15976 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATA1P15976 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATA1P15976 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GATA1P15976 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GATA1P15976 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GATA1P15976 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GATA1P15976 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GATA1P15976 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GATA1P15976 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GATA1P15976 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GATA1P15976 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GATA1P15976 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GATA1P15976 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
GATA1P15976 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GATA1P15976 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GATA1P15976 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
GATA1P15976 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GATA1P15976 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GATA1P15976 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GATA1P15976 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GATA1P15976 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
GATA1P15976 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GATA1P15976 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GATA1P15976 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GATA1P15976 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GATA1P15976 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GATA1P15976 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GATA1P15976 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GATA1P15976 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GATA1P15976 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GATA1P15976 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GATA1P15976 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GATA1P15976 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GATA1P15976 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GATA1P15976 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GATA1P15976 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GATA1P15976 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GATA1P15976 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GATA1P15976 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GATA1P15976 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GATA1P15976 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GATA1P15976 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GATA1P15976 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GATA1P15976 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GATA1P15976 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GATA1P15976 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GATA1P15976 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GATA1P15976 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GATA1P15976 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GATA1P15976 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GATA1P15976 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GATA1P15976 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GATA1P15976 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GATA1P15976 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms