Protein–RNA interactions for Protein: P15336

ATF2, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-2, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF2P15336 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATF2P15336 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATF2P15336 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATF2P15336 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATF2P15336 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATF2P15336 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ATF2P15336 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATF2P15336 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATF2P15336 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ATF2P15336 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATF2P15336 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATF2P15336 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATF2P15336 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATF2P15336 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATF2P15336 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATF2P15336 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATF2P15336 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATF2P15336 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATF2P15336 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATF2P15336 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATF2P15336 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATF2P15336 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATF2P15336 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATF2P15336 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATF2P15336 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATF2P15336 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATF2P15336 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATF2P15336 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATF2P15336 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATF2P15336 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATF2P15336 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATF2P15336 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATF2P15336 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATF2P15336 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ATF2P15336 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATF2P15336 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATF2P15336 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATF2P15336 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATF2P15336 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATF2P15336 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATF2P15336 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATF2P15336 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATF2P15336 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATF2P15336 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATF2P15336 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATF2P15336 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATF2P15336 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATF2P15336 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ATF2P15336 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATF2P15336 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATF2P15336 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATF2P15336 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATF2P15336 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATF2P15336 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATF2P15336 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATF2P15336 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATF2P15336 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATF2P15336 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATF2P15336 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATF2P15336 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATF2P15336 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATF2P15336 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATF2P15336 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATF2P15336 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATF2P15336 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATF2P15336 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATF2P15336 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATF2P15336 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATF2P15336 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATF2P15336 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF2P15336 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF2P15336 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF2P15336 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF2P15336 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF2P15336 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF2P15336 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF2P15336 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF2P15336 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF2P15336 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF2P15336 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF2P15336 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF2P15336 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF2P15336 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF2P15336 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF2P15336 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF2P15336 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF2P15336 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF2P15336 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ATF2P15336 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATF2P15336 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATF2P15336 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATF2P15336 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATF2P15336 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATF2P15336 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATF2P15336 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATF2P15336 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATF2P15336 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATF2P15336 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATF2P15336 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATF2P15336 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms