Protein–RNA interactions for Protein: P14324

FDPS, Farnesyl pyrophosphate synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDPSP14324 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FDPSP14324 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FDPSP14324 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FDPSP14324 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FDPSP14324 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FDPSP14324 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FDPSP14324 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FDPSP14324 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
FDPSP14324 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FDPSP14324 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FDPSP14324 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FDPSP14324 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FDPSP14324 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FDPSP14324 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FDPSP14324 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FDPSP14324 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FDPSP14324 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
FDPSP14324 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
FDPSP14324 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FDPSP14324 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FDPSP14324 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
FDPSP14324 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FDPSP14324 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FDPSP14324 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FDPSP14324 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FDPSP14324 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FDPSP14324 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FDPSP14324 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FDPSP14324 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FDPSP14324 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
FDPSP14324 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FDPSP14324 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FDPSP14324 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FDPSP14324 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
FDPSP14324 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FDPSP14324 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FDPSP14324 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FDPSP14324 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FDPSP14324 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FDPSP14324 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FDPSP14324 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FDPSP14324 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
FDPSP14324 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
FDPSP14324 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
FDPSP14324 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FDPSP14324 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FDPSP14324 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FDPSP14324 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FDPSP14324 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FDPSP14324 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FDPSP14324 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FDPSP14324 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FDPSP14324 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FDPSP14324 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FDPSP14324 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FDPSP14324 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FDPSP14324 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FDPSP14324 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FDPSP14324 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
FDPSP14324 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FDPSP14324 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FDPSP14324 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FDPSP14324 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FDPSP14324 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FDPSP14324 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
FDPSP14324 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FDPSP14324 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FDPSP14324 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FDPSP14324 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
FDPSP14324 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FDPSP14324 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FDPSP14324 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FDPSP14324 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FDPSP14324 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FDPSP14324 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FDPSP14324 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FDPSP14324 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FDPSP14324 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FDPSP14324 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FDPSP14324 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FDPSP14324 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FDPSP14324 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
FDPSP14324 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FDPSP14324 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FDPSP14324 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FDPSP14324 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FDPSP14324 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FDPSP14324 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FDPSP14324 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FDPSP14324 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FDPSP14324 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FDPSP14324 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FDPSP14324 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FDPSP14324 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
FDPSP14324 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FDPSP14324 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FDPSP14324 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FDPSP14324 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FDPSP14324 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FDPSP14324 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms