Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BMP3P12645 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BMP3P12645 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BMP3P12645 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BMP3P12645 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BMP3P12645 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
BMP3P12645 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
BMP3P12645 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BMP3P12645 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BMP3P12645 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BMP3P12645 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BMP3P12645 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BMP3P12645 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BMP3P12645 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BMP3P12645 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BMP3P12645 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BMP3P12645 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BMP3P12645 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BMP3P12645 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BMP3P12645 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BMP3P12645 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BMP3P12645 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BMP3P12645 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BMP3P12645 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BMP3P12645 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BMP3P12645 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BMP3P12645 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BMP3P12645 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BMP3P12645 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BMP3P12645 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BMP3P12645 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BMP3P12645 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BMP3P12645 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BMP3P12645 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BMP3P12645 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BMP3P12645 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BMP3P12645 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BMP3P12645 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BMP3P12645 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BMP3P12645 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BMP3P12645 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BMP3P12645 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
BMP3P12645 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BMP3P12645 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BMP3P12645 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BMP3P12645 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BMP3P12645 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BMP3P12645 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BMP3P12645 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BMP3P12645 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BMP3P12645 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BMP3P12645 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
BMP3P12645 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BMP3P12645 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BMP3P12645 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BMP3P12645 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BMP3P12645 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BMP3P12645 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BMP3P12645 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
BMP3P12645 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BMP3P12645 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
BMP3P12645 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BMP3P12645 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BMP3P12645 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
BMP3P12645 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BMP3P12645 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
BMP3P12645 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BMP3P12645 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BMP3P12645 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BMP3P12645 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BMP3P12645 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
BMP3P12645 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BMP3P12645 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BMP3P12645 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BMP3P12645 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BMP3P12645 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BMP3P12645 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BMP3P12645 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BMP3P12645 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BMP3P12645 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BMP3P12645 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BMP3P12645 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BMP3P12645 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BMP3P12645 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
BMP3P12645 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BMP3P12645 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BMP3P12645 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BMP3P12645 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BMP3P12645 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BMP3P12645 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BMP3P12645 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BMP3P12645 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BMP3P12645 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BMP3P12645 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BMP3P12645 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
BMP3P12645 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BMP3P12645 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BMP3P12645 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BMP3P12645 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BMP3P12645 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms