Protein–RNA interactions for Protein: P12035

KRT3, Keratin, type II cytoskeletal 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT3P12035 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT3P12035 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT3P12035 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT3P12035 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT3P12035 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT3P12035 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT3P12035 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT3P12035 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT3P12035 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT3P12035 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT3P12035 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT3P12035 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT3P12035 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT3P12035 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT3P12035 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT3P12035 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT3P12035 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT3P12035 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT3P12035 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT3P12035 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT3P12035 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT3P12035 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT3P12035 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT3P12035 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT3P12035 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT3P12035 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT3P12035 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT3P12035 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT3P12035 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT3P12035 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT3P12035 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT3P12035 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT3P12035 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT3P12035 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT3P12035 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT3P12035 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT3P12035 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT3P12035 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT3P12035 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT3P12035 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT3P12035 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT3P12035 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT3P12035 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT3P12035 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT3P12035 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT3P12035 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT3P12035 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT3P12035 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT3P12035 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT3P12035 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT3P12035 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT3P12035 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT3P12035 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT3P12035 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT3P12035 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT3P12035 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT3P12035 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT3P12035 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT3P12035 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT3P12035 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT3P12035 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT3P12035 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT3P12035 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT3P12035 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT3P12035 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT3P12035 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT3P12035 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT3P12035 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT3P12035 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT3P12035 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT3P12035 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT3P12035 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT3P12035 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT3P12035 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT3P12035 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT3P12035 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT3P12035 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT3P12035 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT3P12035 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KRT3P12035 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KRT3P12035 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KRT3P12035 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KRT3P12035 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KRT3P12035 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT3P12035 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT3P12035 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT3P12035 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT3P12035 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT3P12035 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT3P12035 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT3P12035 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT3P12035 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT3P12035 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT3P12035 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT3P12035 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT3P12035 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT3P12035 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT3P12035 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT3P12035 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT3P12035 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms