Protein–RNA interactions for Protein: O94898

LRIG2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,065 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG2O94898 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LRIG2O94898 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRIG2O94898 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRIG2O94898 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRIG2O94898 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRIG2O94898 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRIG2O94898 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRIG2O94898 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRIG2O94898 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRIG2O94898 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRIG2O94898 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRIG2O94898 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LRIG2O94898 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRIG2O94898 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRIG2O94898 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRIG2O94898 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRIG2O94898 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRIG2O94898 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LRIG2O94898 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRIG2O94898 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRIG2O94898 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRIG2O94898 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRIG2O94898 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRIG2O94898 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRIG2O94898 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRIG2O94898 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRIG2O94898 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LRIG2O94898 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRIG2O94898 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRIG2O94898 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRIG2O94898 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRIG2O94898 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRIG2O94898 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRIG2O94898 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRIG2O94898 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRIG2O94898 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRIG2O94898 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRIG2O94898 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRIG2O94898 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRIG2O94898 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRIG2O94898 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRIG2O94898 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRIG2O94898 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRIG2O94898 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRIG2O94898 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRIG2O94898 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRIG2O94898 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRIG2O94898 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRIG2O94898 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRIG2O94898 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRIG2O94898 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRIG2O94898 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRIG2O94898 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRIG2O94898 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LRIG2O94898 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRIG2O94898 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LRIG2O94898 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRIG2O94898 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LRIG2O94898 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRIG2O94898 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRIG2O94898 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRIG2O94898 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRIG2O94898 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRIG2O94898 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRIG2O94898 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRIG2O94898 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRIG2O94898 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRIG2O94898 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRIG2O94898 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRIG2O94898 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRIG2O94898 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRIG2O94898 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRIG2O94898 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRIG2O94898 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRIG2O94898 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRIG2O94898 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRIG2O94898 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRIG2O94898 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRIG2O94898 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRIG2O94898 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRIG2O94898 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRIG2O94898 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LRIG2O94898 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRIG2O94898 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LRIG2O94898 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRIG2O94898 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRIG2O94898 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRIG2O94898 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRIG2O94898 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRIG2O94898 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRIG2O94898 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRIG2O94898 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRIG2O94898 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRIG2O94898 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRIG2O94898 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRIG2O94898 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRIG2O94898 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRIG2O94898 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRIG2O94898 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRIG2O94898 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms