Protein–RNA interactions for Protein: O60548

FOXD2, Forkhead box protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 495 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD2O60548 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FOXD2O60548 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FOXD2O60548 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FOXD2O60548 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FOXD2O60548 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FOXD2O60548 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FOXD2O60548 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FOXD2O60548 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXD2O60548 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXD2O60548 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXD2O60548 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXD2O60548 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXD2O60548 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXD2O60548 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXD2O60548 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXD2O60548 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXD2O60548 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXD2O60548 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXD2O60548 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXD2O60548 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXD2O60548 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXD2O60548 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXD2O60548 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXD2O60548 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXD2O60548 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXD2O60548 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXD2O60548 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXD2O60548 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXD2O60548 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXD2O60548 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXD2O60548 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXD2O60548 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXD2O60548 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXD2O60548 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXD2O60548 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXD2O60548 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXD2O60548 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXD2O60548 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXD2O60548 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXD2O60548 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXD2O60548 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXD2O60548 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXD2O60548 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXD2O60548 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXD2O60548 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXD2O60548 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXD2O60548 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXD2O60548 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXD2O60548 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXD2O60548 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXD2O60548 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXD2O60548 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXD2O60548 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXD2O60548 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXD2O60548 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXD2O60548 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXD2O60548 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXD2O60548 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXD2O60548 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXD2O60548 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXD2O60548 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXD2O60548 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXD2O60548 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXD2O60548 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXD2O60548 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXD2O60548 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXD2O60548 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXD2O60548 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXD2O60548 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXD2O60548 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXD2O60548 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXD2O60548 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXD2O60548 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXD2O60548 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXD2O60548 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXD2O60548 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXD2O60548 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXD2O60548 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXD2O60548 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXD2O60548 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXD2O60548 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXD2O60548 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXD2O60548 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXD2O60548 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXD2O60548 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXD2O60548 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXD2O60548 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXD2O60548 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
FOXD2O60548 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXD2O60548 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXD2O60548 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXD2O60548 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXD2O60548 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXD2O60548 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXD2O60548 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXD2O60548 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXD2O60548 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXD2O60548 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXD2O60548 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXD2O60548 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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