Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CREB3O43889 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CREB3O43889 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CREB3O43889 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CREB3O43889 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CREB3O43889 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CREB3O43889 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CREB3O43889 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CREB3O43889 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CREB3O43889 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CREB3O43889 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CREB3O43889 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CREB3O43889 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CREB3O43889 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CREB3O43889 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CREB3O43889 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CREB3O43889 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CREB3O43889 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CREB3O43889 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CREB3O43889 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CREB3O43889 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CREB3O43889 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CREB3O43889 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CREB3O43889 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CREB3O43889 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CREB3O43889 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CREB3O43889 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CREB3O43889 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CREB3O43889 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CREB3O43889 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CREB3O43889 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CREB3O43889 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CREB3O43889 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CREB3O43889 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CREB3O43889 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CREB3O43889 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CREB3O43889 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CREB3O43889 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CREB3O43889 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CREB3O43889 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CREB3O43889 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CREB3O43889 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CREB3O43889 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CREB3O43889 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CREB3O43889 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CREB3O43889 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CREB3O43889 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CREB3O43889 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CREB3O43889 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CREB3O43889 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CREB3O43889 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CREB3O43889 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CREB3O43889 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CREB3O43889 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CREB3O43889 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CREB3O43889 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CREB3O43889 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CREB3O43889 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CREB3O43889 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CREB3O43889 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CREB3O43889 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CREB3O43889 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CREB3O43889 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CREB3O43889 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CREB3O43889 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CREB3O43889 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CREB3O43889 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CREB3O43889 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CREB3O43889 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CREB3O43889 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CREB3O43889 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CREB3O43889 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CREB3O43889 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CREB3O43889 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CREB3O43889 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CREB3O43889 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CREB3O43889 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CREB3O43889 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CREB3O43889 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CREB3O43889 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CREB3O43889 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CREB3O43889 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CREB3O43889 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CREB3O43889 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CREB3O43889 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CREB3O43889 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CREB3O43889 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CREB3O43889 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CREB3O43889 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CREB3O43889 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CREB3O43889 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CREB3O43889 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CREB3O43889 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CREB3O43889 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CREB3O43889 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CREB3O43889 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CREB3O43889 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CREB3O43889 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CREB3O43889 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CREB3O43889 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.3 ms