Protein–RNA interactions for Protein: O43617

TRAPPC3, Trafficking protein particle complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3O43617 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC3O43617 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC3O43617 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC3O43617 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC3O43617 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC3O43617 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC3O43617 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC3O43617 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC3O43617 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC3O43617 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC3O43617 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC3O43617 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC3O43617 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC3O43617 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAPPC3O43617 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAPPC3O43617 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAPPC3O43617 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAPPC3O43617 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAPPC3O43617 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAPPC3O43617 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAPPC3O43617 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAPPC3O43617 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAPPC3O43617 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAPPC3O43617 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC3O43617 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC3O43617 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC3O43617 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC3O43617 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC3O43617 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC3O43617 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC3O43617 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC3O43617 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC3O43617 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC3O43617 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC3O43617 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC3O43617 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC3O43617 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC3O43617 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC3O43617 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC3O43617 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC3O43617 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAPPC3O43617 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAPPC3O43617 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAPPC3O43617 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAPPC3O43617 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAPPC3O43617 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAPPC3O43617 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAPPC3O43617 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAPPC3O43617 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAPPC3O43617 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAPPC3O43617 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAPPC3O43617 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAPPC3O43617 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAPPC3O43617 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAPPC3O43617 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAPPC3O43617 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC3O43617 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC3O43617 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC3O43617 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC3O43617 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC3O43617 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC3O43617 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC3O43617 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC3O43617 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC3O43617 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC3O43617 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC3O43617 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC3O43617 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC3O43617 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC3O43617 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC3O43617 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC3O43617 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC3O43617 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC3O43617 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC3O43617 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC3O43617 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC3O43617 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC3O43617 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC3O43617 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC3O43617 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC3O43617 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC3O43617 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC3O43617 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC3O43617 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC3O43617 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC3O43617 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC3O43617 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC3O43617 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC3O43617 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC3O43617 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC3O43617 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC3O43617 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC3O43617 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC3O43617 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC3O43617 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC3O43617 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC3O43617 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC3O43617 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC3O43617 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC3O43617 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms