Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTIFO43310 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTIFO43310 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTIFO43310 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTIFO43310 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTIFO43310 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTIFO43310 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CTIFO43310 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTIFO43310 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTIFO43310 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTIFO43310 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTIFO43310 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTIFO43310 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTIFO43310 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTIFO43310 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTIFO43310 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTIFO43310 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTIFO43310 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTIFO43310 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTIFO43310 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTIFO43310 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTIFO43310 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTIFO43310 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTIFO43310 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTIFO43310 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTIFO43310 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTIFO43310 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTIFO43310 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTIFO43310 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTIFO43310 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTIFO43310 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTIFO43310 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTIFO43310 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CTIFO43310 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTIFO43310 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTIFO43310 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTIFO43310 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTIFO43310 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTIFO43310 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTIFO43310 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTIFO43310 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTIFO43310 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTIFO43310 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTIFO43310 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTIFO43310 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTIFO43310 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTIFO43310 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTIFO43310 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTIFO43310 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTIFO43310 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTIFO43310 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTIFO43310 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTIFO43310 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTIFO43310 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTIFO43310 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTIFO43310 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTIFO43310 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTIFO43310 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTIFO43310 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTIFO43310 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTIFO43310 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTIFO43310 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTIFO43310 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTIFO43310 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTIFO43310 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTIFO43310 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTIFO43310 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTIFO43310 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTIFO43310 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTIFO43310 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTIFO43310 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTIFO43310 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTIFO43310 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTIFO43310 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTIFO43310 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTIFO43310 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTIFO43310 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTIFO43310 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTIFO43310 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTIFO43310 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CTIFO43310 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTIFO43310 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTIFO43310 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTIFO43310 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTIFO43310 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CTIFO43310 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTIFO43310 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTIFO43310 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTIFO43310 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTIFO43310 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTIFO43310 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTIFO43310 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTIFO43310 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CTIFO43310 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTIFO43310 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTIFO43310 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTIFO43310 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CTIFO43310 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTIFO43310 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTIFO43310 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
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