Protein–RNA interactions for Protein: O14908

GIPC1, PDZ domain-containing protein GIPC1, humanhuman

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Length 333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1O14908 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GIPC1O14908 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GIPC1O14908 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GIPC1O14908 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GIPC1O14908 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GIPC1O14908 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GIPC1O14908 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GIPC1O14908 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GIPC1O14908 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GIPC1O14908 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GIPC1O14908 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GIPC1O14908 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GIPC1O14908 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GIPC1O14908 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GIPC1O14908 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GIPC1O14908 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GIPC1O14908 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GIPC1O14908 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GIPC1O14908 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GIPC1O14908 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GIPC1O14908 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GIPC1O14908 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GIPC1O14908 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GIPC1O14908 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GIPC1O14908 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GIPC1O14908 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GIPC1O14908 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GIPC1O14908 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GIPC1O14908 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GIPC1O14908 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GIPC1O14908 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GIPC1O14908 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GIPC1O14908 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GIPC1O14908 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GIPC1O14908 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GIPC1O14908 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GIPC1O14908 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GIPC1O14908 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GIPC1O14908 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GIPC1O14908 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GIPC1O14908 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GIPC1O14908 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GIPC1O14908 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GIPC1O14908 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GIPC1O14908 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GIPC1O14908 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GIPC1O14908 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GIPC1O14908 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GIPC1O14908 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GIPC1O14908 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GIPC1O14908 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GIPC1O14908 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GIPC1O14908 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GIPC1O14908 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GIPC1O14908 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GIPC1O14908 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GIPC1O14908 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GIPC1O14908 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GIPC1O14908 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GIPC1O14908 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GIPC1O14908 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GIPC1O14908 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GIPC1O14908 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GIPC1O14908 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GIPC1O14908 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GIPC1O14908 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GIPC1O14908 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GIPC1O14908 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GIPC1O14908 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GIPC1O14908 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GIPC1O14908 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GIPC1O14908 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GIPC1O14908 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GIPC1O14908 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GIPC1O14908 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GIPC1O14908 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GIPC1O14908 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GIPC1O14908 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GIPC1O14908 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GIPC1O14908 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GIPC1O14908 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GIPC1O14908 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GIPC1O14908 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GIPC1O14908 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GIPC1O14908 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GIPC1O14908 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GIPC1O14908 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GIPC1O14908 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GIPC1O14908 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GIPC1O14908 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GIPC1O14908 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GIPC1O14908 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GIPC1O14908 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GIPC1O14908 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GIPC1O14908 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GIPC1O14908 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GIPC1O14908 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GIPC1O14908 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GIPC1O14908 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GIPC1O14908 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
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