Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
E2F3O00716 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
E2F3O00716 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
E2F3O00716 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
E2F3O00716 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
E2F3O00716 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
E2F3O00716 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
E2F3O00716 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
E2F3O00716 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
E2F3O00716 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
E2F3O00716 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
E2F3O00716 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
E2F3O00716 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
E2F3O00716 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
E2F3O00716 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
E2F3O00716 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
E2F3O00716 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
E2F3O00716 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
E2F3O00716 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
E2F3O00716 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
E2F3O00716 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
E2F3O00716 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
E2F3O00716 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
E2F3O00716 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
E2F3O00716 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
E2F3O00716 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
E2F3O00716 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
E2F3O00716 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
E2F3O00716 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
E2F3O00716 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
E2F3O00716 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
E2F3O00716 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
E2F3O00716 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
E2F3O00716 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
E2F3O00716 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
E2F3O00716 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
E2F3O00716 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
E2F3O00716 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
E2F3O00716 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
E2F3O00716 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
E2F3O00716 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
E2F3O00716 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
E2F3O00716 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
E2F3O00716 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
E2F3O00716 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
E2F3O00716 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
E2F3O00716 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
E2F3O00716 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2F3O00716 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2F3O00716 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2F3O00716 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2F3O00716 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2F3O00716 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2F3O00716 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2F3O00716 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2F3O00716 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2F3O00716 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2F3O00716 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2F3O00716 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2F3O00716 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2F3O00716 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2F3O00716 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
E2F3O00716 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2F3O00716 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2F3O00716 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2F3O00716 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2F3O00716 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
E2F3O00716 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
E2F3O00716 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
E2F3O00716 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
E2F3O00716 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
E2F3O00716 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
E2F3O00716 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
E2F3O00716 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
E2F3O00716 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
E2F3O00716 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
E2F3O00716 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
E2F3O00716 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
E2F3O00716 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
E2F3O00716 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
E2F3O00716 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
E2F3O00716 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
E2F3O00716 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
E2F3O00716 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
E2F3O00716 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
E2F3O00716 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
E2F3O00716 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
E2F3O00716 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
E2F3O00716 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
E2F3O00716 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
E2F3O00716 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
E2F3O00716 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
E2F3O00716 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
E2F3O00716 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
E2F3O00716 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
E2F3O00716 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
E2F3O00716 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
E2F3O00716 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
E2F3O00716 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
E2F3O00716 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms