Protein–RNA interactions for Protein: H7C0C1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C0C1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H7C0C1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H7C0C1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
H7C0C1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H7C0C1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H7C0C1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H7C0C1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H7C0C1 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
H7C0C1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H7C0C1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H7C0C1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H7C0C1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H7C0C1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H7C0C1 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H7C0C1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H7C0C1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
H7C0C1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H7C0C1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H7C0C1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H7C0C1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
H7C0C1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H7C0C1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H7C0C1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H7C0C1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H7C0C1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
H7C0C1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
H7C0C1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
H7C0C1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
H7C0C1 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H7C0C1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
H7C0C1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
H7C0C1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
H7C0C1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H7C0C1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H7C0C1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
H7C0C1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
H7C0C1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
H7C0C1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H7C0C1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
H7C0C1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H7C0C1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
H7C0C1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
H7C0C1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H7C0C1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
H7C0C1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H7C0C1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H7C0C1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H7C0C1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H7C0C1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H7C0C1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H7C0C1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
H7C0C1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H7C0C1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H7C0C1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
H7C0C1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
H7C0C1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H7C0C1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H7C0C1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H7C0C1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H7C0C1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
H7C0C1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H7C0C1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
H7C0C1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H7C0C1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H7C0C1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
H7C0C1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H7C0C1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H7C0C1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
H7C0C1 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H7C0C1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H7C0C1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
H7C0C1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
H7C0C1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H7C0C1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
H7C0C1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H7C0C1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
H7C0C1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H7C0C1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
H7C0C1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
H7C0C1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
H7C0C1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
H7C0C1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
H7C0C1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
H7C0C1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
H7C0C1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
H7C0C1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H7C0C1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H7C0C1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H7C0C1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
H7C0C1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
H7C0C1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H7C0C1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
H7C0C1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H7C0C1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H7C0C1 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
H7C0C1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
H7C0C1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H7C0C1 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H7C0C1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
H7C0C1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms