Protein–RNA interactions for Protein: A6NEH6

TMEM247, Transmembrane protein 247, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM247A6NEH6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM247A6NEH6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM247A6NEH6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM247A6NEH6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM247A6NEH6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM247A6NEH6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM247A6NEH6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM247A6NEH6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM247A6NEH6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM247A6NEH6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM247A6NEH6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM247A6NEH6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM247A6NEH6 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM247A6NEH6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM247A6NEH6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM247A6NEH6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM247A6NEH6 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM247A6NEH6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM247A6NEH6 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM247A6NEH6 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM247A6NEH6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM247A6NEH6 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM247A6NEH6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM247A6NEH6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM247A6NEH6 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM247A6NEH6 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM247A6NEH6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM247A6NEH6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM247A6NEH6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM247A6NEH6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM247A6NEH6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM247A6NEH6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM247A6NEH6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM247A6NEH6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM247A6NEH6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM247A6NEH6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM247A6NEH6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM247A6NEH6 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM247A6NEH6 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM247A6NEH6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM247A6NEH6 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM247A6NEH6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM247A6NEH6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM247A6NEH6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM247A6NEH6 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM247A6NEH6 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM247A6NEH6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM247A6NEH6 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM247A6NEH6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM247A6NEH6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM247A6NEH6 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM247A6NEH6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM247A6NEH6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM247A6NEH6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM247A6NEH6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM247A6NEH6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM247A6NEH6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMEM247A6NEH6 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMEM247A6NEH6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMEM247A6NEH6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMEM247A6NEH6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMEM247A6NEH6 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMEM247A6NEH6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMEM247A6NEH6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMEM247A6NEH6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM247A6NEH6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM247A6NEH6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM247A6NEH6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM247A6NEH6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM247A6NEH6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM247A6NEH6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM247A6NEH6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM247A6NEH6 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM247A6NEH6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM247A6NEH6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM247A6NEH6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM247A6NEH6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM247A6NEH6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM247A6NEH6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM247A6NEH6 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM247A6NEH6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM247A6NEH6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM247A6NEH6 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM247A6NEH6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM247A6NEH6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM247A6NEH6 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM247A6NEH6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM247A6NEH6 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM247A6NEH6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM247A6NEH6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM247A6NEH6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM247A6NEH6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM247A6NEH6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM247A6NEH6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM247A6NEH6 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM247A6NEH6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM247A6NEH6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM247A6NEH6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM247A6NEH6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM247A6NEH6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 156.2 ms