Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VWA3AA6NCI4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VWA3AA6NCI4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
VWA3AA6NCI4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VWA3AA6NCI4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VWA3AA6NCI4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VWA3AA6NCI4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VWA3AA6NCI4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VWA3AA6NCI4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VWA3AA6NCI4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
VWA3AA6NCI4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VWA3AA6NCI4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VWA3AA6NCI4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VWA3AA6NCI4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VWA3AA6NCI4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VWA3AA6NCI4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
VWA3AA6NCI4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VWA3AA6NCI4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
VWA3AA6NCI4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
VWA3AA6NCI4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
VWA3AA6NCI4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VWA3AA6NCI4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VWA3AA6NCI4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VWA3AA6NCI4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VWA3AA6NCI4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VWA3AA6NCI4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
VWA3AA6NCI4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VWA3AA6NCI4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
VWA3AA6NCI4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VWA3AA6NCI4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VWA3AA6NCI4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VWA3AA6NCI4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VWA3AA6NCI4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VWA3AA6NCI4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VWA3AA6NCI4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VWA3AA6NCI4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VWA3AA6NCI4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VWA3AA6NCI4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VWA3AA6NCI4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VWA3AA6NCI4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VWA3AA6NCI4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VWA3AA6NCI4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VWA3AA6NCI4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
VWA3AA6NCI4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VWA3AA6NCI4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VWA3AA6NCI4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VWA3AA6NCI4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VWA3AA6NCI4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VWA3AA6NCI4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VWA3AA6NCI4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VWA3AA6NCI4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VWA3AA6NCI4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
VWA3AA6NCI4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VWA3AA6NCI4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
VWA3AA6NCI4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VWA3AA6NCI4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VWA3AA6NCI4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VWA3AA6NCI4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VWA3AA6NCI4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VWA3AA6NCI4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VWA3AA6NCI4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VWA3AA6NCI4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VWA3AA6NCI4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VWA3AA6NCI4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VWA3AA6NCI4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VWA3AA6NCI4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VWA3AA6NCI4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VWA3AA6NCI4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VWA3AA6NCI4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VWA3AA6NCI4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VWA3AA6NCI4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VWA3AA6NCI4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VWA3AA6NCI4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VWA3AA6NCI4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VWA3AA6NCI4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VWA3AA6NCI4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VWA3AA6NCI4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VWA3AA6NCI4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
VWA3AA6NCI4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VWA3AA6NCI4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VWA3AA6NCI4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
VWA3AA6NCI4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
VWA3AA6NCI4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VWA3AA6NCI4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VWA3AA6NCI4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VWA3AA6NCI4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VWA3AA6NCI4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VWA3AA6NCI4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VWA3AA6NCI4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VWA3AA6NCI4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VWA3AA6NCI4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VWA3AA6NCI4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VWA3AA6NCI4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VWA3AA6NCI4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VWA3AA6NCI4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VWA3AA6NCI4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VWA3AA6NCI4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
VWA3AA6NCI4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
VWA3AA6NCI4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VWA3AA6NCI4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms