Protein–RNA interactions for Protein: A4GXA9

EME2, Probable crossover junction endonuclease EME2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EME2A4GXA9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EME2A4GXA9 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
EME2A4GXA9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EME2A4GXA9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EME2A4GXA9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
EME2A4GXA9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EME2A4GXA9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EME2A4GXA9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EME2A4GXA9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EME2A4GXA9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EME2A4GXA9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EME2A4GXA9 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EME2A4GXA9 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EME2A4GXA9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EME2A4GXA9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EME2A4GXA9 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EME2A4GXA9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EME2A4GXA9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EME2A4GXA9 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EME2A4GXA9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EME2A4GXA9 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EME2A4GXA9 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EME2A4GXA9 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EME2A4GXA9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EME2A4GXA9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EME2A4GXA9 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EME2A4GXA9 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EME2A4GXA9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EME2A4GXA9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EME2A4GXA9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EME2A4GXA9 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EME2A4GXA9 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EME2A4GXA9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
EME2A4GXA9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EME2A4GXA9 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EME2A4GXA9 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EME2A4GXA9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EME2A4GXA9 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EME2A4GXA9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EME2A4GXA9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EME2A4GXA9 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EME2A4GXA9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EME2A4GXA9 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EME2A4GXA9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EME2A4GXA9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EME2A4GXA9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EME2A4GXA9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EME2A4GXA9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EME2A4GXA9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EME2A4GXA9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
EME2A4GXA9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EME2A4GXA9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EME2A4GXA9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EME2A4GXA9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EME2A4GXA9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EME2A4GXA9 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EME2A4GXA9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EME2A4GXA9 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EME2A4GXA9 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EME2A4GXA9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
EME2A4GXA9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EME2A4GXA9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EME2A4GXA9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
EME2A4GXA9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EME2A4GXA9 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EME2A4GXA9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EME2A4GXA9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EME2A4GXA9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EME2A4GXA9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EME2A4GXA9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EME2A4GXA9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
EME2A4GXA9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
EME2A4GXA9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
EME2A4GXA9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
EME2A4GXA9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EME2A4GXA9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EME2A4GXA9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EME2A4GXA9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EME2A4GXA9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EME2A4GXA9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EME2A4GXA9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EME2A4GXA9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EME2A4GXA9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EME2A4GXA9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EME2A4GXA9 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EME2A4GXA9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EME2A4GXA9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EME2A4GXA9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EME2A4GXA9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EME2A4GXA9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
EME2A4GXA9 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EME2A4GXA9 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EME2A4GXA9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EME2A4GXA9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EME2A4GXA9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EME2A4GXA9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EME2A4GXA9 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EME2A4GXA9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EME2A4GXA9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EME2A4GXA9 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms