Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
E2F8A0AVK6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
E2F8A0AVK6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
E2F8A0AVK6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
E2F8A0AVK6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
E2F8A0AVK6 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
E2F8A0AVK6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
E2F8A0AVK6 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
E2F8A0AVK6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
E2F8A0AVK6 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
E2F8A0AVK6 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
E2F8A0AVK6 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
E2F8A0AVK6 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
E2F8A0AVK6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
E2F8A0AVK6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
E2F8A0AVK6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
E2F8A0AVK6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
E2F8A0AVK6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
E2F8A0AVK6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
E2F8A0AVK6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
E2F8A0AVK6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
E2F8A0AVK6 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
E2F8A0AVK6 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
E2F8A0AVK6 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
E2F8A0AVK6 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
E2F8A0AVK6 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
E2F8A0AVK6 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
E2F8A0AVK6 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
E2F8A0AVK6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
E2F8A0AVK6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
E2F8A0AVK6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
E2F8A0AVK6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
E2F8A0AVK6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
E2F8A0AVK6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
E2F8A0AVK6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
E2F8A0AVK6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
E2F8A0AVK6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
E2F8A0AVK6 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
E2F8A0AVK6 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
E2F8A0AVK6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
E2F8A0AVK6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
E2F8A0AVK6 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
E2F8A0AVK6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
E2F8A0AVK6 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E2F8A0AVK6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E2F8A0AVK6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
E2F8A0AVK6 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E2F8A0AVK6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
E2F8A0AVK6 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
E2F8A0AVK6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E2F8A0AVK6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
E2F8A0AVK6 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
E2F8A0AVK6 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
E2F8A0AVK6 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
E2F8A0AVK6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
E2F8A0AVK6 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
E2F8A0AVK6 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
E2F8A0AVK6 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
E2F8A0AVK6 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
E2F8A0AVK6 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
E2F8A0AVK6 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
E2F8A0AVK6 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
E2F8A0AVK6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
E2F8A0AVK6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
E2F8A0AVK6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
E2F8A0AVK6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
E2F8A0AVK6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
E2F8A0AVK6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
E2F8A0AVK6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
E2F8A0AVK6 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
E2F8A0AVK6 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
E2F8A0AVK6 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
E2F8A0AVK6 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
E2F8A0AVK6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
E2F8A0AVK6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
E2F8A0AVK6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
E2F8A0AVK6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
E2F8A0AVK6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
E2F8A0AVK6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
E2F8A0AVK6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
E2F8A0AVK6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
E2F8A0AVK6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
E2F8A0AVK6 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
E2F8A0AVK6 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
E2F8A0AVK6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
E2F8A0AVK6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
E2F8A0AVK6 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
E2F8A0AVK6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
E2F8A0AVK6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
E2F8A0AVK6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
E2F8A0AVK6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
E2F8A0AVK6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
E2F8A0AVK6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
E2F8A0AVK6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
E2F8A0AVK6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
E2F8A0AVK6 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
E2F8A0AVK6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
E2F8A0AVK6 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
E2F8A0AVK6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
E2F8A0AVK6 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms