Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4F1

FARP1, FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARP1Q9Y4F1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FARP1Q9Y4F1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FARP1Q9Y4F1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FARP1Q9Y4F1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FARP1Q9Y4F1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FARP1Q9Y4F1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FARP1Q9Y4F1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FARP1Q9Y4F1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FARP1Q9Y4F1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FARP1Q9Y4F1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FARP1Q9Y4F1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FARP1Q9Y4F1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FARP1Q9Y4F1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FARP1Q9Y4F1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FARP1Q9Y4F1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FARP1Q9Y4F1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FARP1Q9Y4F1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FARP1Q9Y4F1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FARP1Q9Y4F1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FARP1Q9Y4F1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FARP1Q9Y4F1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FARP1Q9Y4F1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FARP1Q9Y4F1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FARP1Q9Y4F1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FARP1Q9Y4F1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FARP1Q9Y4F1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FARP1Q9Y4F1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FARP1Q9Y4F1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FARP1Q9Y4F1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FARP1Q9Y4F1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FARP1Q9Y4F1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FARP1Q9Y4F1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FARP1Q9Y4F1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FARP1Q9Y4F1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FARP1Q9Y4F1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FARP1Q9Y4F1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FARP1Q9Y4F1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FARP1Q9Y4F1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FARP1Q9Y4F1 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FARP1Q9Y4F1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FARP1Q9Y4F1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FARP1Q9Y4F1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FARP1Q9Y4F1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FARP1Q9Y4F1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FARP1Q9Y4F1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FARP1Q9Y4F1 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FARP1Q9Y4F1 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FARP1Q9Y4F1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FARP1Q9Y4F1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FARP1Q9Y4F1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FARP1Q9Y4F1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FARP1Q9Y4F1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FARP1Q9Y4F1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FARP1Q9Y4F1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FARP1Q9Y4F1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FARP1Q9Y4F1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FARP1Q9Y4F1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FARP1Q9Y4F1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FARP1Q9Y4F1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FARP1Q9Y4F1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FARP1Q9Y4F1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FARP1Q9Y4F1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FARP1Q9Y4F1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FARP1Q9Y4F1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FARP1Q9Y4F1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FARP1Q9Y4F1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FARP1Q9Y4F1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FARP1Q9Y4F1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FARP1Q9Y4F1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FARP1Q9Y4F1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FARP1Q9Y4F1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FARP1Q9Y4F1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FARP1Q9Y4F1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FARP1Q9Y4F1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FARP1Q9Y4F1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FARP1Q9Y4F1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FARP1Q9Y4F1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FARP1Q9Y4F1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FARP1Q9Y4F1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FARP1Q9Y4F1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FARP1Q9Y4F1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FARP1Q9Y4F1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FARP1Q9Y4F1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FARP1Q9Y4F1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FARP1Q9Y4F1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FARP1Q9Y4F1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FARP1Q9Y4F1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FARP1Q9Y4F1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FARP1Q9Y4F1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FARP1Q9Y4F1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FARP1Q9Y4F1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FARP1Q9Y4F1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FARP1Q9Y4F1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FARP1Q9Y4F1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FARP1Q9Y4F1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FARP1Q9Y4F1 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FARP1Q9Y4F1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FARP1Q9Y4F1 AL355338.1-201ENST00000612598 913 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FARP1Q9Y4F1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FARP1Q9Y4F1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms