Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y385

UBE2J1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J1Q9Y385 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2J1Q9Y385 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2J1Q9Y385 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2J1Q9Y385 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2J1Q9Y385 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2J1Q9Y385 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2J1Q9Y385 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2J1Q9Y385 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2J1Q9Y385 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2J1Q9Y385 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2J1Q9Y385 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2J1Q9Y385 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2J1Q9Y385 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2J1Q9Y385 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2J1Q9Y385 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2J1Q9Y385 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2J1Q9Y385 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2J1Q9Y385 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2J1Q9Y385 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2J1Q9Y385 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2J1Q9Y385 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2J1Q9Y385 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2J1Q9Y385 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2J1Q9Y385 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2J1Q9Y385 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2J1Q9Y385 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2J1Q9Y385 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2J1Q9Y385 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2J1Q9Y385 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2J1Q9Y385 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2J1Q9Y385 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2J1Q9Y385 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2J1Q9Y385 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2J1Q9Y385 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2J1Q9Y385 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2J1Q9Y385 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2J1Q9Y385 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2J1Q9Y385 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2J1Q9Y385 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2J1Q9Y385 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2J1Q9Y385 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2J1Q9Y385 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE2J1Q9Y385 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE2J1Q9Y385 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE2J1Q9Y385 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE2J1Q9Y385 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE2J1Q9Y385 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE2J1Q9Y385 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE2J1Q9Y385 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE2J1Q9Y385 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE2J1Q9Y385 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE2J1Q9Y385 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE2J1Q9Y385 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE2J1Q9Y385 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE2J1Q9Y385 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE2J1Q9Y385 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE2J1Q9Y385 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
UBE2J1Q9Y385 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE2J1Q9Y385 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE2J1Q9Y385 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE2J1Q9Y385 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE2J1Q9Y385 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE2J1Q9Y385 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE2J1Q9Y385 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE2J1Q9Y385 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE2J1Q9Y385 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE2J1Q9Y385 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE2J1Q9Y385 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE2J1Q9Y385 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE2J1Q9Y385 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE2J1Q9Y385 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE2J1Q9Y385 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE2J1Q9Y385 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE2J1Q9Y385 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE2J1Q9Y385 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE2J1Q9Y385 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE2J1Q9Y385 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE2J1Q9Y385 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE2J1Q9Y385 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE2J1Q9Y385 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE2J1Q9Y385 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE2J1Q9Y385 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE2J1Q9Y385 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE2J1Q9Y385 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE2J1Q9Y385 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE2J1Q9Y385 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE2J1Q9Y385 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE2J1Q9Y385 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE2J1Q9Y385 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE2J1Q9Y385 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE2J1Q9Y385 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE2J1Q9Y385 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE2J1Q9Y385 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE2J1Q9Y385 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE2J1Q9Y385 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE2J1Q9Y385 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE2J1Q9Y385 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE2J1Q9Y385 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE2J1Q9Y385 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE2J1Q9Y385 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms